More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1321 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  91.21 
 
 
279 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  91.21 
 
 
279 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  91.21 
 
 
273 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  91.21 
 
 
279 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  91.21 
 
 
279 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  91.21 
 
 
279 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  90.84 
 
 
273 aa  500  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  91.21 
 
 
273 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  86.45 
 
 
273 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  76.81 
 
 
276 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  76.81 
 
 
276 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  73.11 
 
 
278 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  72.73 
 
 
278 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  74.44 
 
 
278 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  73.11 
 
 
278 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  76.3 
 
 
276 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  77.46 
 
 
276 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  67.98 
 
 
243 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  67.98 
 
 
243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  65.22 
 
 
237 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  65.79 
 
 
259 aa  322  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  61.54 
 
 
243 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  61.57 
 
 
251 aa  301  8.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  60.85 
 
 
235 aa  298  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  59.31 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  58.19 
 
 
243 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  59.38 
 
 
235 aa  278  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 
248 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  59.57 
 
 
247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 
241 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  59.13 
 
 
246 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  54.55 
 
 
242 aa  271  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  59.13 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  58.44 
 
 
243 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  58.7 
 
 
243 aa  269  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 
243 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  57.58 
 
 
243 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  56.28 
 
 
240 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  58.7 
 
 
244 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  58.01 
 
 
243 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  57.39 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  55.7 
 
 
233 aa  258  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  54.98 
 
 
253 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  55.22 
 
 
232 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  52.48 
 
 
246 aa  247  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  54.2 
 
 
239 aa  245  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  52.61 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  54.63 
 
 
226 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  49.57 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  51.5 
 
 
239 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  50.64 
 
 
241 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  50.87 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  48.71 
 
 
237 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  51.09 
 
 
230 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  51.09 
 
 
230 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2612  NAD-dependent deacetylase  51.56 
 
 
228 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000726932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2492  Silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2216  silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  53.65 
 
 
233 aa  192  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  44.93 
 
 
244 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  52.15 
 
 
233 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  45.49 
 
 
251 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  47.83 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  49.74 
 
 
230 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  47.29 
 
 
229 aa  179  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 
269 aa  178  8e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  43.62 
 
 
256 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  45.02 
 
 
245 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  45.37 
 
 
233 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  48.7 
 
 
242 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  46.27 
 
 
234 aa  168  8e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  44.07 
 
 
227 aa  168  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  40.41 
 
 
249 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  42.8 
 
 
251 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  45.61 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  41.18 
 
 
230 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  43.87 
 
 
245 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  40.85 
 
 
244 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  47.92 
 
 
226 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  42.33 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  46.81 
 
 
229 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  39.58 
 
 
248 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  39.84 
 
 
266 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  38.67 
 
 
230 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  44.76 
 
 
249 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1487  Silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.72672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  41.23 
 
 
241 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  40.44 
 
 
247 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1194  NAD-dependent deacetylase  38.61 
 
 
233 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0597441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1071  NAD-dependent deacetylase  38.12 
 
 
233 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.202923  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1154  conserved hypothetical protein, putative NAD-dependent deacetylase  40.21 
 
 
232 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000113398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>