263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1280 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  79.42 
 
 		 547 aa  876    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  79.24 
 
 		 547 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 		 547 aa  877    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 		 547 aa  878    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  69.62 
 
 		 546 aa  783    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 		 547 aa  876    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 553 aa  1105    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  78.88 
 
 		 547 aa  871    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 		 547 aa  877    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  79.06 
 
 		 547 aa  872    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 553 aa  1105    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 553 aa  1105    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 553 aa  1105    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  79.42 
 
 		 547 aa  876    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 553 aa  1105    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  56.19 
 
 		 554 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  56.19 
 
 		 554 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  56.01 
 
 		 554 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  55.68 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  56.41 
 
 		 568 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1877  flagellar hook-associated protein FlgK  56.29 
 
 		 556 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  49.82 
 
 		 551 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  43.12 
 
 		 539 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  44.02 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  53.01 
 
 		 640 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  37.68 
 
 		 631 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  43.52 
 
 		 631 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  43.75 
 
 		 652 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  37.67 
 
 		 645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  38.8 
 
 		 683 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  36.29 
 
 		 637 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  34.7 
 
 		 549 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  36.18 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  35.96 
 
 		 667 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  36.04 
 
 		 714 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  36.04 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  35.59 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  36.04 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  36.04 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  36.04 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  36.04 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  33.56 
 
 		 920 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  36.07 
 
 		 657 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  34.89 
 
 		 657 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  37.82 
 
 		 629 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  35.57 
 
 		 638 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 		 681 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  34.69 
 
 		 647 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  32.39 
 
 		 683 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.97 
 
 		 682 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  34.68 
 
 		 676 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  33.85 
 
 		 682 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  36.24 
 
 		 660 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  34.91 
 
 		 659 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 		 645 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 		 645 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  35.21 
 
 		 641 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  34.33 
 
 		 665 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  34.1 
 
 		 665 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  33.41 
 
 		 643 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  33.41 
 
 		 643 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  33.41 
 
 		 643 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  34.99 
 
 		 642 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 		 624 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 		 624 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  31.21 
 
 		 688 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  34.92 
 
 		 626 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  34.51 
 
 		 653 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.74 
 
 		 680 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  31.79 
 
 		 644 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  36.01 
 
 		 640 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 		 640 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.74 
 
 		 680 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  33.26 
 
 		 686 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  32.36 
 
 		 681 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  31.64 
 
 		 686 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  31.36 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  32.81 
 
 		 642 aa  190  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  31.14 
 
 		 649 aa  190  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  30.27 
 
 		 685 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  30.11 
 
 		 672 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 		 695 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  30.11 
 
 		 691 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 		 642 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  26.31 
 
 		 630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.45 
 
 		 560 aa  179  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  34.99 
 
 		 660 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  28.24 
 
 		 583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 		 658 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  31.68 
 
 		 658 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 		 646 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 		 477 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  28.82 
 
 		 680 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 		 637 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 		 642 aa  153  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  24.33 
 
 		 626 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 		 638 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  28.23 
 
 		 640 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>