More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1207 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  88.56 
 
 
306 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  88.56 
 
 
306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  88.24 
 
 
306 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  88.24 
 
 
306 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  88.24 
 
 
306 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  88.24 
 
 
306 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  87.91 
 
 
306 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  88.24 
 
 
306 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  88.24 
 
 
306 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  73.05 
 
 
309 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  55.73 
 
 
313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  55.62 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  54.66 
 
 
319 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.35 
 
 
319 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  54.21 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.92 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  56.01 
 
 
314 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  54.14 
 
 
314 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  49.7 
 
 
316 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  47.99 
 
 
320 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  45.05 
 
 
313 aa  252  7e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  45.05 
 
 
341 aa  251  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.79 
 
 
324 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.61 
 
 
315 aa  245  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  44.3 
 
 
315 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  43.4 
 
 
313 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  42.06 
 
 
320 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  45.93 
 
 
296 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  45.6 
 
 
296 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  42.02 
 
 
327 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  43.22 
 
 
315 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.26 
 
 
319 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  44.23 
 
 
308 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  40.99 
 
 
326 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  47.44 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  47.44 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  43.08 
 
 
313 aa  208  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  42.07 
 
 
304 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.46 
 
 
323 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  41.16 
 
 
321 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  36.64 
 
 
324 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  40.92 
 
 
311 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  38.75 
 
 
330 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.72 
 
 
313 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.22 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.58 
 
 
324 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.01 
 
 
325 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.38 
 
 
315 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.33 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.91 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.94 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  40.99 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.21 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  37.13 
 
 
324 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  42.09 
 
 
304 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  40.19 
 
 
297 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  35.03 
 
 
380 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.15 
 
 
324 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  40.38 
 
 
313 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  34.76 
 
 
378 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  32.43 
 
 
387 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  32.39 
 
 
373 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  34 
 
 
375 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  38.53 
 
 
316 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  38.76 
 
 
295 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  38.27 
 
 
326 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  35.14 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  32.16 
 
 
383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.65 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.65 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0491  dnaJ domain-containing protein  39.7 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0918592  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  32.95 
 
 
373 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.67 
 
 
289 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  35.39 
 
 
379 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  35.39 
 
 
379 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  33.24 
 
 
387 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  35.39 
 
 
379 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  35.39 
 
 
379 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  35.39 
 
 
379 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  32.58 
 
 
373 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  37.03 
 
 
366 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  32.51 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  31.78 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  35.11 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  35.11 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  35.11 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  35.11 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  31.58 
 
 
376 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  33.8 
 
 
376 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  34.1 
 
 
335 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  34.83 
 
 
376 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  35.11 
 
 
376 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  34.55 
 
 
376 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  34.83 
 
 
376 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1106  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.08 
 
 
323 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.495657  normal  0.506463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>