More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1042 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  100 
 
 		 430 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  99.77 
 
 		 446 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  99.53 
 
 		 446 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  63.92 
 
 		 428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  57.62 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  57.62 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  54.45 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  49.41 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  50.86 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  43.41 
 
 		 411 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  43.41 
 
 		 411 aa  342  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  43.17 
 
 		 411 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  40.19 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  36.05 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  47.45 
 
 		 255 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  31.76 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  31.51 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.98 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  28.74 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.86 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.36 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  27.88 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  26.27 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  27.25 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  27.46 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  26.65 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  30.59 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.66 
 
 		 391 aa  123  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 386 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  26.02 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  26.37 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.96 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.27 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.78 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  27.41 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.66 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  34.66 
 
 		 190 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  23.86 
 
 		 359 aa  99.8  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.62 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  28.52 
 
 		 292 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2141  hypothetical protein  54.93 
 
 		 140 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.91 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  26.72 
 
 		 273 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  24.61 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  27.41 
 
 		 357 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.08 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.82 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.85 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.15 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.7 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  25.62 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.99 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.79 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.21 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  22.92 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  21.78 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  23.88 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.86 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2290  putative transposase  51.52 
 
 		 68 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.417357  hitchhiker  0.0000000000265233 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  23.54 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.87 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.71 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.09 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  22.05 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  24.23 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.28 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  23.53 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  23.13 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  22.85 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  22.46 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  21.61 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.29 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.38 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  21.91 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  27.05 
 
 		 276 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  22.6 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  23.73 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  24.32 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  21.88 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  22.85 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.06 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.43 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  23.86 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  22.63 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  24 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.32 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.32 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  23.7 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  22.67 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  22.49 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>