More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0756 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  99.61 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  99.61 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  90.16 
 
 		 254 aa  474  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  89.76 
 
 		 254 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  89.76 
 
 		 254 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  80.78 
 
 		 257 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  67.46 
 
 		 259 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  65.87 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  63.89 
 
 		 259 aa  348  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  65.48 
 
 		 255 aa  348  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  65.08 
 
 		 255 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  63.53 
 
 		 260 aa  343  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  64.57 
 
 		 260 aa  341  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  63.49 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  47.9 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  47.9 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  46.69 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  42.47 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  41.9 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  43.93 
 
 		 262 aa  191  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  40.15 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  37.66 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  41.7 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  41.06 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  39.75 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  37.86 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  41.63 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  39.69 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  39.56 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  39.34 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.06 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  36.55 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  36.25 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  38.25 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  37.16 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  41 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  33.07 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  33.08 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  36.1 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  29.96 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 		 227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.93 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  32.27 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.6 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  28.68 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  27.48 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  30 
 
 		 356 aa  85.5  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.03 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>