More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0321 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  34.85 
 
 		 1379 aa  655    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1386 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  100 
 
 		 1359 aa  2804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  38.89 
 
 		 1385 aa  796    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  38.99 
 
 		 1400 aa  806    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1419 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  39.3 
 
 		 1410 aa  814    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  38.28 
 
 		 1418 aa  801    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  37.3 
 
 		 1229 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  38.98 
 
 		 1409 aa  800    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  37.51 
 
 		 1390 aa  810    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  38.62 
 
 		 1411 aa  779    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  38.51 
 
 		 1402 aa  806    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  36.51 
 
 		 1140 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  32.37 
 
 		 1446 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  32.86 
 
 		 1421 aa  572  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  33.36 
 
 		 1531 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  32.33 
 
 		 1568 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  35.21 
 
 		 1149 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  37.21 
 
 		 855 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  34.69 
 
 		 1149 aa  513  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  34.11 
 
 		 1150 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.2 
 
 		 1150 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  34.11 
 
 		 1150 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  34.01 
 
 		 1150 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  31.09 
 
 		 1530 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  33.18 
 
 		 1348 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  31.87 
 
 		 1362 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  33.84 
 
 		 924 aa  439  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  36.45 
 
 		 867 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1604 aa  412  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  34.61 
 
 		 866 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1583 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  29.07 
 
 		 1654 aa  389  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  31.15 
 
 		 1611 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1547 aa  366  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1520 aa  360  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  30.34 
 
 		 1560 aa  354  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1586 aa  349  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1554 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1527 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1550 aa  340  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1602 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.43 
 
 		 1429 aa  334  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1551 aa  333  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  29.17 
 
 		 1614 aa  318  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.1 
 
 		 1586 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.11 
 
 		 1485 aa  314  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.55 
 
 		 1595 aa  313  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.25 
 
 		 1609 aa  311  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.14 
 
 		 1517 aa  311  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  27.06 
 
 		 1494 aa  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1494 aa  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.96 
 
 		 1576 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  27.92 
 
 		 1475 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1541 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  27.85 
 
 		 1457 aa  303  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  26.27 
 
 		 1437 aa  303  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1541 aa  303  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1541 aa  303  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1541 aa  301  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1541 aa  301  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1541 aa  301  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  26.91 
 
 		 1626 aa  300  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  28.13 
 
 		 1572 aa  298  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.14 
 
 		 1573 aa  298  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1381 aa  298  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.12 
 
 		 1981 aa  297  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.66 
 
 		 1518 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1487 aa  295  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1197 aa  295  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  26.12 
 
 		 1422 aa  295  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1505 aa  294  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  26.56 
 
 		 1616 aa  294  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.35 
 
 		 1488 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.33 
 
 		 1528 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  27.72 
 
 		 1423 aa  292  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1600 aa  291  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  27.55 
 
 		 1508 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1553 aa  288  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1492 aa  286  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1495 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  24.84 
 
 		 1447 aa  282  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1466 aa  282  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  25.27 
 
 		 1428 aa  280  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1527 aa  279  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  35.94 
 
 		 561 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1319 aa  268  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.09 
 
 		 1495 aa  266  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  34.29 
 
 		 555 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.07 
 
 		 1489 aa  261  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  27.09 
 
 		 1528 aa  255  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  26.31 
 
 		 1189 aa  252  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  26.05 
 
 		 1384 aa  251  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.35 
 
 		 1259 aa  251  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.29 
 
 		 1539 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.82 
 
 		 1509 aa  246  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1317 aa  246  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.26 
 
 		 1434 aa  244  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  33.4 
 
 		 497 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>