133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0302 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  100 
 
 
161 aa  336  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  100 
 
 
161 aa  336  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  99.38 
 
 
161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  93.79 
 
 
161 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  93.79 
 
 
161 aa  321  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  94.41 
 
 
161 aa  320  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  93.17 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  66.88 
 
 
160 aa  222  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  69.38 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  69.38 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  70 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  69.38 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  69.38 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  69.38 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  69.38 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  69.38 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  70 
 
 
161 aa  221  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  70.62 
 
 
161 aa  220  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  71.25 
 
 
161 aa  219  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  71.25 
 
 
161 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  63.29 
 
 
160 aa  214  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  63.29 
 
 
160 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  63.29 
 
 
160 aa  213  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  63.92 
 
 
160 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  66.25 
 
 
160 aa  207  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  63.29 
 
 
160 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  63.29 
 
 
160 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  55.7 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  55.7 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  55.7 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  52.2 
 
 
155 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  57.59 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  55.7 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  56.77 
 
 
157 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  49.37 
 
 
160 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  48.45 
 
 
160 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.54 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  45.96 
 
 
161 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.39 
 
 
165 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  50.41 
 
 
129 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.51 
 
 
161 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  38.18 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  33.74 
 
 
163 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  39.38 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  39.88 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  43.75 
 
 
162 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  43.12 
 
 
162 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  32.52 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  39.38 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  38.27 
 
 
160 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  38.27 
 
 
160 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  37.13 
 
 
172 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  37.13 
 
 
172 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  37.13 
 
 
172 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  35.19 
 
 
160 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  38 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.93 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  34.91 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.5 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  34.32 
 
 
172 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  34.32 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  32.47 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.32 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  34.72 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  32.52 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  35.8 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  31.9 
 
 
163 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  31.29 
 
 
181 aa  84  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  28.12 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  30.06 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  31.21 
 
 
165 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.87 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  28.03 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.77 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  30.97 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  30.57 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  30.97 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6054  hypothetical protein  26.11 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  29.37 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  27.39 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  27.39 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.77 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  27.39 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.963871 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>