More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0286 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0286  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
251 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0291  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
251 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0305  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
251 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0299  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
251 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0284  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.6 
 
 
251 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0216  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.09 
 
 
251 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00257158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0217  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.950184  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  78.49 
 
 
251 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0208  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  72.91 
 
 
251 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  58.96 
 
 
280 aa  323  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  58.96 
 
 
251 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.96 
 
 
251 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.37 
 
 
251 aa  315  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.98 
 
 
251 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0909  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.77 
 
 
251 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.830211  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.99 
 
 
250 aa  281  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0475  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.19 
 
 
257 aa  265  5e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  48.19 
 
 
252 aa  261  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  45.82 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.22 
 
 
252 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.82 
 
 
252 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.95 
 
 
257 aa  234  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.87 
 
 
263 aa  234  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  49.02 
 
 
255 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.12 
 
 
259 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.79 
 
 
258 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.49 
 
 
259 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.49 
 
 
257 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.58 
 
 
258 aa  222  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.58 
 
 
258 aa  222  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.49 
 
 
258 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.53 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.75 
 
 
257 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  47.56 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  45 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.33 
 
 
259 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
258 aa  218  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
259 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  44.23 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.01 
 
 
259 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.12 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
257 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.11 
 
 
266 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
257 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
259 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.14 
 
 
259 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.46 
 
 
259 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.24 
 
 
267 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.36 
 
 
263 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
257 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.15 
 
 
245 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
273 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.17 
 
 
257 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.47 
 
 
258 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  41.86 
 
 
265 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.31 
 
 
269 aa  204  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  42.15 
 
 
257 aa  204  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.8 
 
 
255 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.46 
 
 
268 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.7 
 
 
258 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.44 
 
 
263 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.02 
 
 
258 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.06 
 
 
263 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.02 
 
 
256 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.06 
 
 
263 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.38 
 
 
257 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.38 
 
 
257 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.69 
 
 
260 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  40.6 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.47 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.97 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.14 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
273 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
273 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.06 
 
 
263 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  40.75 
 
 
266 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
295 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
295 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  39.55 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  43.87 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.87 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.84 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.31 
 
 
268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  42.31 
 
 
268 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.31 
 
 
268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.31 
 
 
268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.31 
 
 
268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>