More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0284 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  100 
 
 
256 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  98.83 
 
 
256 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  98.44 
 
 
256 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  98.44 
 
 
256 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  98.44 
 
 
256 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  75.29 
 
 
256 aa  404  1e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.12 
 
 
256 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  73.73 
 
 
256 aa  400  1e-110  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  71.76 
 
 
256 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  72.94 
 
 
256 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  60.8 
 
 
257 aa  319  2e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  72.06 
 
 
207 aa  313  1e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  72.06 
 
 
207 aa  313  1e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  71.57 
 
 
207 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  70.59 
 
 
207 aa  308  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  61.04 
 
 
256 aa  306  2e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  70.1 
 
 
207 aa  305  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  58.8 
 
 
255 aa  298  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  59.13 
 
 
256 aa  298  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  58.27 
 
 
254 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  57.09 
 
 
254 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  56.69 
 
 
254 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  56.69 
 
 
254 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  56.92 
 
 
255 aa  283  2e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  57.96 
 
 
253 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  53.41 
 
 
250 aa  265  6e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  54.22 
 
 
250 aa  265  6e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  52.21 
 
 
250 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  52.8 
 
 
256 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  5.01952e-05 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  52.21 
 
 
250 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  51.81 
 
 
250 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  51.81 
 
 
250 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  51.81 
 
 
250 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  53.06 
 
 
261 aa  255  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  54.66 
 
 
250 aa  253  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.61 
 
 
251 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  51.21 
 
 
250 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  50.81 
 
 
250 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  51.59 
 
 
258 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.01 
 
 
251 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  53.01 
 
 
251 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  61.9 
 
 
212 aa  243  1e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.61 
 
 
251 aa  244  1e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  52.21 
 
 
251 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  50.81 
 
 
259 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  60.85 
 
 
204 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  50.78 
 
 
261 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  51.21 
 
 
259 aa  234  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  51.21 
 
 
259 aa  233  2e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  48.61 
 
 
261 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  46.64 
 
 
264 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  47.88 
 
 
256 aa  228  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  48.56 
 
 
254 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  50 
 
 
258 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  48.56 
 
 
254 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  48.18 
 
 
250 aa  220  2e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  48.18 
 
 
250 aa  220  2e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  61.9 
 
 
173 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  46.06 
 
 
260 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  58.24 
 
 
187 aa  211  6e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  47.41 
 
 
254 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.62 
 
 
261 aa  147  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  32.2 
 
 
261 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.2 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.2 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.78 
 
 
261 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1066  putative methyltransferase  31.13 
 
 
273 aa  135  6e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.95873e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
264 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  31.36 
 
 
261 aa  134  2e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.93 
 
 
261 aa  133  2e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.36 
 
 
261 aa  132  4e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.89 
 
 
257 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  35.33 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.52 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.89 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  43.33 
 
 
178 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.19 
 
 
259 aa  82.8  5e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  42.48 
 
 
209 aa  82.4  7e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.48 
 
 
207 aa  81.3  1e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.79 
 
 
213 aa  81.3  2e-14  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  80.1  3e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  32.77 
 
 
258 aa  79  7e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.84 
 
 
245 aa  78.6  1e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  30.67 
 
 
258 aa  77.4  2e-13  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.78 
 
 
249 aa  77.4  2e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.85 
 
 
207 aa  77.4  2e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
1002 aa  77.4  2e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  38.17 
 
 
267 aa  77  3e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.52 
 
 
249 aa  76.6  4e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.95 
 
 
241 aa  76.3  4e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
203 aa  76.3  5e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 
246 aa  75.9  6e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.23 
 
 
233 aa  75.9  6e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.05 
 
 
249 aa  75.9  6e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
295 aa  74.7  1e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
237 aa  74.7  1e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>