More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0252 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  99.49 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  99.49 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  93.43 
 
 		 198 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  92.93 
 
 		 198 aa  376  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  93.43 
 
 		 198 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  92.93 
 
 		 198 aa  376  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  92.93 
 
 		 198 aa  376  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  93.43 
 
 		 198 aa  377  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  92.93 
 
 		 198 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  92.42 
 
 		 198 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  92.42 
 
 		 198 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  88.89 
 
 		 198 aa  361  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  85.05 
 
 		 198 aa  343  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  85.05 
 
 		 198 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  84.54 
 
 		 198 aa  340  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  82.9 
 
 		 198 aa  329  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  84.26 
 
 		 197 aa  329  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  82.38 
 
 		 198 aa  327  9e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  82.9 
 
 		 198 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  82.38 
 
 		 198 aa  325  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  71.88 
 
 		 211 aa  283  8e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  70.1 
 
 		 212 aa  281  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  70.1 
 
 		 207 aa  278  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  68.56 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  72.83 
 
 		 213 aa  275  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  73.8 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  69.89 
 
 		 206 aa  271  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  72.13 
 
 		 218 aa  267  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  71.74 
 
 		 201 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  72.13 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  72.13 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  71.04 
 
 		 217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  71.43 
 
 		 208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  71.2 
 
 		 201 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  71.58 
 
 		 207 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  69.68 
 
 		 207 aa  264  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  64.88 
 
 		 217 aa  264  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  66.32 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  69.4 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  67.74 
 
 		 197 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  66.48 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  72.22 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  67.71 
 
 		 214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  65.62 
 
 		 213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1459  ribonuclease HII  66.49 
 
 		 210 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0235521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  69.95 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1464  ribonuclease HII  66.49 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0142588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  65.76 
 
 		 190 aa  237  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2888  ribonuclease HII  65.98 
 
 		 210 aa  237  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0614829  normal  0.459177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  67.02 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2694  ribonuclease HII  67.54 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.529016  hitchhiker  0.00296162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  69.11 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1362  ribonuclease HII  66.49 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  68.25 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1495  ribonuclease HII  65.98 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0185949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  65.95 
 
 		 208 aa  234  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  63.93 
 
 		 198 aa  227  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  64.89 
 
 		 203 aa  227  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  59.89 
 
 		 193 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  59.79 
 
 		 218 aa  225  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  58.76 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  59.89 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  61.41 
 
 		 209 aa  220  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  65.41 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  65.76 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  60.41 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  64.13 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  60.11 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  64.13 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  59.69 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  59.36 
 
 		 232 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  59.16 
 
 		 232 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  64.06 
 
 		 213 aa  214  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  62.5 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  61.54 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  56.99 
 
 		 226 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  62.22 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  61.41 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  61.67 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  57.65 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  58.64 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  57.36 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  57.36 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  58.15 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  58.7 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 214 aa  207  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 214 aa  207  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 214 aa  207  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 214 aa  207  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 214 aa  207  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  58.67 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  57.14 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  57.51 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  59.16 
 
 		 240 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>