63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0221 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  100 
 
 		 176 aa  356  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  98.3 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  97.16 
 
 		 176 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  84.09 
 
 		 176 aa  298  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  46.02 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  45.66 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  49.68 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  49.68 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  41.24 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  41.95 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  44 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  44 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  43.42 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  42.58 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  42.11 
 
 		 178 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  41.94 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  34.32 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  35.16 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  29.94 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  32.03 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  44.44 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  31.84 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  30.87 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  31.17 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  26.71 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  27.67 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  27.69 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  29.81 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  29.81 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.11 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  29.81 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.57 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  24.85 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  27.1 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.85 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  27.03 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  27.61 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  27.61 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  27.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  27.61 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  24.81 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  26.8 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.13 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  26.15 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  26.11 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  26.15 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  26.11 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  26.11 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  26.11 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  26.15 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  26.15 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  26.11 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  26.15 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  29.51 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  30.48 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  28.46 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  28.39 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  28.39 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  29.93 
 
 		 360 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  26.17 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  26.17 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  26.35 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  26.17 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>