More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0155 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0159  type IV pilin biogenesis protein  98.25 
 
 
400 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0156  type IV pilin biogenesis protein  99.25 
 
 
400 aa  801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0805411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0162  type IV pilin biogenesis protein  99 
 
 
400 aa  799    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00079869  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0154  type IV pilin biogenesis protein  98.75 
 
 
400 aa  798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0155  type IV pilin biogenesis protein  100 
 
 
400 aa  804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000866014  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00105  assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein  68 
 
 
400 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3496  type II secretion system protein  68 
 
 
400 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0110  type IV pilin biogenesis protein  67.75 
 
 
400 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000393014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00104  hypothetical protein  68 
 
 
400 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0098  type IV pilin biogenesis protein  67.75 
 
 
400 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00354832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3553  type IV pilin biogenesis protein  68 
 
 
400 aa  543  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0112  type IV pilin biogenesis protein  66.75 
 
 
400 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0263524  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0109  type IV pilin biogenesis protein  67.25 
 
 
400 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0111048  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0650  type IV pilin biogenesis protein  55.78 
 
 
398 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3577  type IV pilin biogenesis protein  39.15 
 
 
401 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  38.44 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0776  type IV pilin biogenesis protein  42.14 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3764  type IV pilin biogenesis protein  39.4 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1043  type IV pilin biogenesis protein  38.19 
 
 
399 aa  272  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0343376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3500  type IV pilin biogenesis protein  40.52 
 
 
378 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0664  type IV pilin biogenesis protein  36.72 
 
 
400 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0625  type IV pilin biogenesis protein  40.5 
 
 
401 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  31.67 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  30.53 
 
 
407 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  30.48 
 
 
419 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.72 
 
 
405 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.42 
 
 
408 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  31 
 
 
419 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  31.25 
 
 
407 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.37 
 
 
403 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.85 
 
 
423 aa  205  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  28.97 
 
 
405 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  30.47 
 
 
405 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  30.23 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  29.57 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  29.6 
 
 
405 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  28.78 
 
 
417 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  29.97 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.4 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  29.85 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  28.64 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  28.32 
 
 
422 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  29.59 
 
 
401 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.98 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  29.93 
 
 
422 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  30 
 
 
420 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.47 
 
 
421 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  31.22 
 
 
410 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  28.33 
 
 
409 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.32 
 
 
405 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  29.1 
 
 
409 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  27.39 
 
 
419 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0424  type II secretion system protein  28.61 
 
 
421 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  28.36 
 
 
405 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  28.11 
 
 
404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3424  type II secretion system protein  30.27 
 
 
421 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.760778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.51 
 
 
404 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.64 
 
 
419 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.71 
 
 
410 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  27.65 
 
 
405 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0418  type II secretion system protein  30.6 
 
 
423 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.11378  hitchhiker  0.00766616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  29.01 
 
 
405 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.84 
 
 
405 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  29.26 
 
 
405 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.97 
 
 
402 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  29.35 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  26.84 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  29.73 
 
 
421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  29.52 
 
 
420 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  29.52 
 
 
424 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  25.88 
 
 
401 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2682  type II secretion system protein  28.49 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0414992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  28.53 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  26.55 
 
 
404 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  28.83 
 
 
421 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  29.6 
 
 
423 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  28.97 
 
 
405 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  29.25 
 
 
406 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  29.92 
 
 
405 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3390  type II secretion system protein  30.79 
 
 
422 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.68 
 
 
408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  28.21 
 
 
424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  26.45 
 
 
417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0481  type II secretion system protein, type IV pilus biogenesis protein PilC  31.16 
 
 
410 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  27.81 
 
 
407 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  26.7 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  29.15 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  28.64 
 
 
407 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  26.7 
 
 
417 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  29.19 
 
 
409 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.74 
 
 
405 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  26.67 
 
 
417 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.85 
 
 
409 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  28.75 
 
 
405 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  27.75 
 
 
412 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  26.5 
 
 
405 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  26.67 
 
 
463 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  26.67 
 
 
463 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  29.53 
 
 
411 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  29.52 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>