39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0064 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0064  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 
97 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.346396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0066  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 
97 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0065  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 
97 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0063  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 
97 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0064  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 
97 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0324  citrate lyase subunit gamma  55.67 
 
 
98 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1753  citrate lyase subunit gamma  50.52 
 
 
96 aa  103  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.268986  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2219  citrate lyase subunit gamma  53.61 
 
 
97 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2321  citrate lyase subunit gamma  54.64 
 
 
96 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3170  citrate lyase subunit gamma  51.04 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420368  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3374  citrate lyase subunit gamma  51.55 
 
 
97 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2026  citrate lyase subunit gamma  47.42 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2409  citrate lyase subunit gamma  48.45 
 
 
98 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1163  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 
101 aa  94.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.495535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0668  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.966565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0639  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3027  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0636  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00574  hypothetical protein  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00585  citrate lyase, acyl carrier (gamma) subunit  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0705  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3008  citrate lyase acyl carrier protein  48.94 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0531  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0736  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 
98 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0723  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 
98 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.853845  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0663  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 
98 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0782  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 
98 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0677  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 
98 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4208  citrate lyase subunit gamma  46.59 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000860507  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0421  citrate lyase subunit gamma  45.92 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04670  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.56 
 
 
94 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1633  citrate lyase subunit gamma  42.7 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3946  citrate lyase subunit gamma  44.19 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000495279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1087  citrate lyase subunit gamma  42.05 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3861  citrate lyase subunit gamma  44.19 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  39.47 
 
 
406 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1369  citrate lyase acyl carrier protein  39.29 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0022  citrate lyase subunit gamma  32.97 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0339  citrate lyase subunit gamma  33.71 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>