24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0022 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0021  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.141705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0023  putative cytoplasmic protein  99.57 
 
 		 234 aa  486  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.524077  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0022  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0022  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  0.262139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0022  putative cytoplasmic protein  99.57 
 
 		 230 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687075  normal  0.0626657 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5009  putative inner membrane protein  40.21 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.177455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4920  putative inner membrane protein  40.21 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0734962  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4847  hypothetical protein  40.21 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.646649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5006  hypothetical protein  40.21 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4954  hypothetical protein  40.21 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00326  hypothetical protein  31.43 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00322  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0438  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0447  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3234  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0403  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3257  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0397  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.63792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0292  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.95 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.940457 
 
 
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NC_009436  Ent638_2176  hypothetical protein  28.7 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2177  hypothetical protein  24.64 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1067  putative inner membrane protein  26.44 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3403  hypothetical protein  26.74 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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