More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2553 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 451 aa  926    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  84.77 
 
 		 453 aa  796    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  84.77 
 
 		 453 aa  796    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  60.62 
 
 		 450 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  60.36 
 
 		 450 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  61.8 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  61.99 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  61.76 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  61.76 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  61.76 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  61.76 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  61.99 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  61.76 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  61.99 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  61.76 
 
 		 446 aa  544  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  60.72 
 
 		 446 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.48 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.44 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  54.57 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  54.57 
 
 		 457 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  55.08 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.57 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  54.85 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  53.38 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  51.46 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.12 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  52.37 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.03 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.13 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  54.26 
 
 		 443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  51.01 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.44 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.02 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.22 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.15 
 
 		 456 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  45.13 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.02 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  43.97 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  47.64 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.51 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  44.87 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.75 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  43.17 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.53 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  44.79 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.53 
 
 		 591 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  42.92 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.31 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.7 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  42.25 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.04 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.23 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  43.53 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  43.53 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  45.01 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.54 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  42.67 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.19 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  56 
 
 		 615 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  53.85 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  54.14 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  42.67 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  44.54 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  54.14 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  43.39 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  54.14 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.76 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  53.25 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  42.38 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  42.22 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.18 
 
 		 562 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.26 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  41.54 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  42.79 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  41.76 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  42.98 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  52.54 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  42.92 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  41.63 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  41.63 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  52.23 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  42.36 
 
 		 482 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  42.92 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  40.42 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  42.23 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  43.24 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  42.16 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  42.41 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>