More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2549 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.62 
 
 		 642 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  53.76 
 
 		 650 aa  647    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  54.96 
 
 		 654 aa  683    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 		 642 aa  678    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  59.28 
 
 		 795 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  52.89 
 
 		 665 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  56.47 
 
 		 654 aa  712    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  56.08 
 
 		 638 aa  721    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  52.42 
 
 		 666 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 643 aa  1322    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  55.27 
 
 		 627 aa  671    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  70.62 
 
 		 640 aa  876    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  55.43 
 
 		 654 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 		 651 aa  672    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.7 
 
 		 643 aa  697    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  65.67 
 
 		 650 aa  828    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  52.43 
 
 		 653 aa  647    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  51.22 
 
 		 656 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  52.7 
 
 		 646 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  70.62 
 
 		 640 aa  875    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  55.43 
 
 		 654 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  70.62 
 
 		 640 aa  875    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  55.43 
 
 		 654 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  55.61 
 
 		 635 aa  711    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  55.36 
 
 		 644 aa  709    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  70.3 
 
 		 640 aa  871    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  55.43 
 
 		 654 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  55.56 
 
 		 686 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  70.46 
 
 		 640 aa  875    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  63.41 
 
 		 649 aa  781    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 		 675 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  57.08 
 
 		 661 aa  687    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  54.22 
 
 		 655 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  60.7 
 
 		 633 aa  750    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  56.03 
 
 		 645 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 		 658 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  54.83 
 
 		 655 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.93 
 
 		 795 aa  661    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  55.47 
 
 		 644 aa  685    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  55.19 
 
 		 655 aa  697    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  55.71 
 
 		 637 aa  691    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  55.67 
 
 		 655 aa  702    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  58.92 
 
 		 795 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.87 
 
 		 636 aa  685    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  93.44 
 
 		 640 aa  1188    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  70.62 
 
 		 640 aa  875    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  55.43 
 
 		 654 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  59.94 
 
 		 642 aa  720    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  55.12 
 
 		 655 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  57.62 
 
 		 645 aa  680    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  54.73 
 
 		 634 aa  707    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  63.04 
 
 		 634 aa  786    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  55.3 
 
 		 655 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  54.13 
 
 		 647 aa  695    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.16 
 
 		 675 aa  685    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  55.43 
 
 		 719 aa  680    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  59.14 
 
 		 794 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  59.46 
 
 		 632 aa  768    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  54.8 
 
 		 654 aa  680    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  62.01 
 
 		 641 aa  764    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.71 
 
 		 636 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  55.59 
 
 		 648 aa  680    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  57.12 
 
 		 645 aa  677    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  53.62 
 
 		 645 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 		 675 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  57.28 
 
 		 644 aa  749    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  52.19 
 
 		 714 aa  673    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  55.45 
 
 		 655 aa  692    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  55.88 
 
 		 652 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  65.25 
 
 		 638 aa  777    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  65.41 
 
 		 638 aa  777    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  58.73 
 
 		 635 aa  722    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  55.38 
 
 		 649 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  54.06 
 
 		 655 aa  681    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  61.81 
 
 		 633 aa  799    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.02 
 
 		 642 aa  672    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  64.53 
 
 		 651 aa  811    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  52.64 
 
 		 644 aa  647    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  60.25 
 
 		 652 aa  781    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  53.44 
 
 		 653 aa  683    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  64.04 
 
 		 655 aa  772    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  62.52 
 
 		 640 aa  808    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  61.32 
 
 		 672 aa  762    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  52.89 
 
 		 663 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  52.73 
 
 		 649 aa  646    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  65.46 
 
 		 650 aa  817    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  54.19 
 
 		 696 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  59.55 
 
 		 628 aa  760    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  55.63 
 
 		 644 aa  703    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  93.44 
 
 		 640 aa  1188    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  55.15 
 
 		 666 aa  679    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  54.2 
 
 		 696 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  55.47 
 
 		 643 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  66.03 
 
 		 638 aa  797    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 		 675 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  53.31 
 
 		 675 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  52.71 
 
 		 675 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  70.21 
 
 		 640 aa  867    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  66.35 
 
 		 633 aa  813    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  54.5 
 
 		 651 aa  706    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>