More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2547 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2547  YjeF-related protein  100 
 
 		 271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0007  hypothetical protein  87.04 
 
 		 270 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.365981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0007  hypothetical protein  87.04 
 
 		 270 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1292  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.98 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0263  sugar kinase  46.97 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1527  sugar kinase  46.59 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0661  hypothetical protein  45.83 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0495  hypothetical protein  44.87 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0463  sugar kinase  41.09 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.787563 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0658  sugar kinase  42.11 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 492 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  33.96 
 
 		 499 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  34.44 
 
 		 499 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.12 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.08 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  34.73 
 
 		 510 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.12 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.12 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.92 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  34.73 
 
 		 514 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  35.71 
 
 		 494 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  31.27 
 
 		 496 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.29 
 
 		 515 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  31.64 
 
 		 496 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  32.94 
 
 		 499 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.92 
 
 		 498 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  32.6 
 
 		 462 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  32.21 
 
 		 493 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.82 
 
 		 488 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0520  hypothetical protein  35.11 
 
 		 586 aa  125  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75104  decreased coverage  0.0023767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.61 
 
 		 504 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.9 
 
 		 492 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  31.48 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  32.21 
 
 		 493 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  32.63 
 
 		 496 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.47 
 
 		 510 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.61 
 
 		 504 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.47 
 
 		 499 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  29.29 
 
 		 512 aa  123  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.2 
 
 		 504 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  28.32 
 
 		 512 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.74 
 
 		 509 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.8 
 
 		 496 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  35.98 
 
 		 513 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.04 
 
 		 502 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.61 
 
 		 486 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.74 
 
 		 488 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.66 
 
 		 524 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  33.48 
 
 		 496 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  33.89 
 
 		 503 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.52 
 
 		 502 aa  118  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  33.05 
 
 		 510 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.51 
 
 		 516 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.45 
 
 		 492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 520 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  34.27 
 
 		 512 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.47 
 
 		 492 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.79 
 
 		 493 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  33.05 
 
 		 510 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  33.05 
 
 		 510 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  32.64 
 
 		 515 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.05 
 
 		 515 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  32.64 
 
 		 515 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  33.05 
 
 		 515 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.33 
 
 		 506 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  33.05 
 
 		 515 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.11 
 
 		 514 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.11 
 
 		 514 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.11 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.11 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.11 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0525  YjeF-like protein  33.33 
 
 		 590 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.069696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  32.23 
 
 		 508 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.77 
 
 		 492 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.57 
 
 		 507 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  35.15 
 
 		 513 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  32.64 
 
 		 515 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 494 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.04 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.04 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.86 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.05 
 
 		 499 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.04 
 
 		 494 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.35 
 
 		 490 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.51 
 
 		 501 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.05 
 
 		 509 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.6 
 
 		 499 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.46 
 
 		 499 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.19 
 
 		 499 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.75 
 
 		 499 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  33.76 
 
 		 496 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.41 
 
 		 514 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  32.9 
 
 		 495 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.09 
 
 		 490 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 		 528 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.32 
 
 		 559 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.62 
 
 		 494 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.78 
 
 		 504 aa  105  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  32.79 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 		 520 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>