More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2538 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  296  7e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  89.19 
 
 		 148 aa  239  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  89.19 
 
 		 148 aa  239  7e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  61.49 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  57.43 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  54 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  60.14 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  59.46 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  54.67 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  54.36 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  48.97 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  47.68 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  47.92 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  42.66 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.24 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  41.26 
 
 		 174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  47.92 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 191 aa  110  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2140  50S ribosomal protein L9  52.41 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  45.19 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.73 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  39.85 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  41.6 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  36.36 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  35.86 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  34.25 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  32.87 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  34.97 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  36.5 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.43 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  34.97 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.75 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  34.97 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.9 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  34.97 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  40.29 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  40.44 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 151 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>