More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2537 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  100 
 
 
466 aa  963    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  96.13 
 
 
466 aa  911    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  96.13 
 
 
466 aa  911    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  60.36 
 
 
453 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  59.02 
 
 
453 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  59.02 
 
 
453 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  59.02 
 
 
453 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  59.02 
 
 
453 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  59.02 
 
 
453 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  59.02 
 
 
453 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  59.02 
 
 
453 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  58.57 
 
 
453 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  58.57 
 
 
449 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  58.39 
 
 
454 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  57.95 
 
 
454 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  53.16 
 
 
463 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  51.87 
 
 
459 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  50 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  49.34 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  49.56 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  50.33 
 
 
446 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  49.34 
 
 
444 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.55 
 
 
445 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  51.11 
 
 
453 aa  436  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  46.43 
 
 
441 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  51.43 
 
 
455 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  49.67 
 
 
443 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  47.68 
 
 
456 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  47.69 
 
 
442 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  46.62 
 
 
449 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.33 
 
 
449 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  50.32 
 
 
457 aa  428  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.8 
 
 
456 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  50.66 
 
 
451 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  47.02 
 
 
447 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  47.22 
 
 
449 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  62.92 
 
 
318 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  46.19 
 
 
442 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  47.77 
 
 
440 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  47.1 
 
 
444 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
442 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  46.61 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  47.14 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  47.44 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  45.1 
 
 
447 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  46.78 
 
 
458 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  46.04 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  46.8 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  45.75 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  46.1 
 
 
461 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  45.2 
 
 
473 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  45.45 
 
 
462 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  44.44 
 
 
451 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  45.85 
 
 
472 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  44.44 
 
 
451 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  45.03 
 
 
471 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  45.03 
 
 
471 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.97 
 
 
460 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  45.88 
 
 
465 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
453 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  44.69 
 
 
488 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  45.93 
 
 
469 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  45.15 
 
 
450 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  44.01 
 
 
469 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  43.46 
 
 
481 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
468 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  43.04 
 
 
445 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  45.63 
 
 
472 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  43.93 
 
 
460 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  43.93 
 
 
460 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.1 
 
 
456 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  43.04 
 
 
446 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  44.54 
 
 
461 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  44.2 
 
 
471 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  45.63 
 
 
472 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  46.04 
 
 
462 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  45.58 
 
 
468 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  45.58 
 
 
468 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  43.01 
 
 
454 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  45.58 
 
 
468 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  45.58 
 
 
468 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  44.98 
 
 
477 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  45.58 
 
 
468 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  43.98 
 
 
445 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  45.8 
 
 
463 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
444 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
468 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  43.38 
 
 
472 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
468 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  44.1 
 
 
472 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
464 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  42.57 
 
 
458 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  43.33 
 
 
468 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  40.44 
 
 
481 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  43.23 
 
 
456 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  43.14 
 
 
513 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  44.35 
 
 
464 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  44.79 
 
 
468 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  44.35 
 
 
468 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>