More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2536 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 427 aa  877    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  70.73 
 
 		 430 aa  646    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  71.66 
 
 		 429 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  71.66 
 
 		 429 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  92.74 
 
 		 427 aa  822    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  71.66 
 
 		 429 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  71.66 
 
 		 429 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  92.74 
 
 		 427 aa  822    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  70.26 
 
 		 429 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  71.43 
 
 		 430 aa  654    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  69.32 
 
 		 428 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  71.43 
 
 		 429 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  69.09 
 
 		 428 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  71.43 
 
 		 429 aa  617  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  71.19 
 
 		 429 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  71.43 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  70.96 
 
 		 429 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  70.96 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  69.16 
 
 		 430 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  59.72 
 
 		 429 aa  551  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  60.89 
 
 		 432 aa  547  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  56.03 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  52.22 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  54.59 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  55.37 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  55.5 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  52.62 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  54.74 
 
 		 428 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  54.39 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  54.5 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  53.27 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  50.82 
 
 		 807 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1126  adenylosuccinate synthetase  53.4 
 
 		 436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00711413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 427 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  52.49 
 
 		 439 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 		 437 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 		 434 aa  448  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl074  adenylosuccinate synthetase  50.7 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  49.4 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  47.65 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  50.71 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  49.06 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  47.07 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  49.88 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  48.11 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 432 aa  431  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  50.47 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  52.86 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  47.64 
 
 		 439 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0767  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>