17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2531 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2531  yycI protein  100 
 
 
263 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0021  hypothetical protein  64.64 
 
 
262 aa  349  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0021  hypothetical protein  64.64 
 
 
262 aa  349  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3406  hypothetical protein  28.62 
 
 
260 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.621085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5256  hypothetical protein  27.71 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3535  hypothetical protein  26.97 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4003  hypothetical protein  27.27 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5586  yycI protein  26.05 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5160  hypothetical protein  26.82 
 
 
280 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5647  yycI protein  26.82 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0613428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5349  yycI protein  26.05 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000493723  hitchhiker  0.00000000000000821365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5144  hypothetical protein  27.59 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5569  yycI protein  27.59 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5175299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5612  hypothetical protein  27.1 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5712  hypothetical protein  27.2 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5316  yycI protein  27.2 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0022  hypothetical protein  24.29 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>