101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2519 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  100 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  100 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  61.98 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2747  CopY family transcriptional regulator  61.16 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.513766  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2824  penicillinase repressor  61.16 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.167752  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0005  penicillinase repressor  61.26 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.014635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  41.88 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  42.15 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  42.24 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  37.9 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  37.9 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  38.71 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  38.46 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  37.9 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  37.9 
 
 		 133 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  39.83 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  31.9 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  31.03 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  32.17 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  27.83 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  31.09 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  30.17 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0049  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  27.73 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  27.59 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  29.2 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  32.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  32.17 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  22.12 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  31.53 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1648  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0889  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  25.44 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  30.25 
 
 		 124 aa  57  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  30.7 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  20.91 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  26.55 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  24.58 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  24.59 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  28.95 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  23.85 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  23.85 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  25.86 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  22.03 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  26.45 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  19.49 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  28.7 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  21.74 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  18.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  20 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  20.87 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  20.87 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  22.12 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  23.71 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  31.03 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  21.19 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  20 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  19.66 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  23.08 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  23.85 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  18.58 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  19.49 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  22.83 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  21.37 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 122 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  19.3 
 
 		 120 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  31.13 
 
 		 126 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  23.68 
 
 		 119 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  24.17 
 
 		 117 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  18.97 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2069  CopY family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0076  transcriptional repressor, CopY family  19.17 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726818  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  23.28 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  30.91 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>