48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2496 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  96.82 
 
 
597 aa  1194  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1229  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  96.82 
 
 
597 aa  1194  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  61.27 
 
 
298 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  61.27 
 
 
298 aa  371  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0064  hypothetical protein  50.18 
 
 
289 aa  293  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2484  hypothetical protein  50.18 
 
 
289 aa  293  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  23.06 
 
 
842 aa  83.6  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  32.92 
 
 
658 aa  79.7  1e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  25.43 
 
 
631 aa  79.3  2e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  27.34 
 
 
582 aa  78.6  3e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  25.6 
 
 
633 aa  78.2  4e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  25.81 
 
 
574 aa  77.4  6e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  27.33 
 
 
591 aa  77.4  7e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  25.09 
 
 
890 aa  74.3  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  25.09 
 
 
890 aa  74.3  6e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  22.59 
 
 
689 aa  73.9  7e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  22.88 
 
 
953 aa  73.6  9e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  22.12 
 
 
979 aa  73.2  1e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  22.51 
 
 
958 aa  72  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  22.51 
 
 
958 aa  72  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  27.31 
 
 
580 aa  71.6  4e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  22.51 
 
 
955 aa  71.2  4e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  22.51 
 
 
950 aa  71.2  5e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  22.14 
 
 
953 aa  70.5  8e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  22.51 
 
 
950 aa  70.5  8e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  25.08 
 
 
624 aa  68.9  2e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  25 
 
 
930 aa  68.2  4e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  24.77 
 
 
895 aa  68.2  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  25.55 
 
 
911 aa  67.8  5e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  30.58 
 
 
1051 aa  67.4  8e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  23.3 
 
 
556 aa  67  9e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  21.77 
 
 
955 aa  66.2  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  28 
 
 
841 aa  65.5  3e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  27.88 
 
 
676 aa  63.5  9e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  22.26 
 
 
709 aa  62.8  2e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  23.53 
 
 
515 aa  60.1  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  23.86 
 
 
553 aa  59.3  2e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  24.36 
 
 
627 aa  58.2  5e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  26.21 
 
 
929 aa  52.4  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.04 
 
 
970 aa  51.2  5e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.04 
 
 
970 aa  50.8  6e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.27 
 
 
713 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  22.07 
 
 
711 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  23.68 
 
 
899 aa  48.5  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  25 
 
 
897 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  25.44 
 
 
878 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  27.36 
 
 
845 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>