More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2386 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  100 
 
 
293 aa  601  1e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  56.75 
 
 
296 aa  359  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  56.75 
 
 
296 aa  359  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  34.67 
 
 
307 aa  189  6e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.33 
 
 
307 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.23465e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.33 
 
 
307 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  34.33 
 
 
328 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.33 
 
 
307 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78714e-14 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  34.33 
 
 
307 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.33 
 
 
320 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.33 
 
 
307 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.33 
 
 
318 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34 
 
 
305 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  33.22 
 
 
310 aa  179  5e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  33.45 
 
 
308 aa  147  2e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  28.05 
 
 
308 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  28.05 
 
 
308 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  28.25 
 
 
308 aa  119  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  26.49 
 
 
596 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  26.87 
 
 
640 aa  118  1e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  29.13 
 
 
313 aa  114  2e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  25.96 
 
 
308 aa  111  2e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  25.96 
 
 
308 aa  110  4e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  27.8 
 
 
395 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  27.09 
 
 
624 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  29.92 
 
 
433 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  27.49 
 
 
394 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  31.12 
 
 
438 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.46 
 
 
395 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  26.78 
 
 
395 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  27.46 
 
 
395 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  27.12 
 
 
395 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 
364 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  28.48 
 
 
349 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  27.46 
 
 
395 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  29.92 
 
 
437 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  30.31 
 
 
436 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  26.54 
 
 
614 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  31.53 
 
 
438 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  30.31 
 
 
436 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  27.12 
 
 
395 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  27.46 
 
 
527 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  30.45 
 
 
437 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  30.45 
 
 
437 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  30.45 
 
 
470 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  29.22 
 
 
446 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  28.95 
 
 
322 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  26 
 
 
625 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.22 
 
 
446 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.22 
 
 
446 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  29.22 
 
 
446 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.22 
 
 
446 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.92 
 
 
519 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.22 
 
 
446 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  30.51 
 
 
333 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  29.01 
 
 
316 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  29.82 
 
 
435 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  32.31 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 
328 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  32.26 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  32.26 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  32.26 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  32.26 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  26.81 
 
 
342 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  32.26 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  31.79 
 
 
328 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  5.85707e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  29.57 
 
 
435 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  31.79 
 
 
337 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 
337 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8505e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  31.79 
 
 
337 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  31.79 
 
 
362 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  4.16664e-08 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  26.54 
 
 
344 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  25.51 
 
 
356 aa  99  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  28.94 
 
 
406 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.63 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  33.91 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.01 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  32.07 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  26.15 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.01 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  28.2 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.63 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.63 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.63 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  28.32 
 
 
442 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  28.63 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  32.97 
 
 
344 aa  97.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  30.93 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  26.53 
 
 
352 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.63 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  28.32 
 
 
442 aa  96.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.51 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  25.74 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.33 
 
 
400 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 
345 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.30504e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  30.39 
 
 
366 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  3.43665e-05 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.33 
 
 
400 aa  96.3  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 
402 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  25.16 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>