More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2382 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  100 
 
 
305 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  42.09 
 
 
323 aa  252  5e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  42.23 
 
 
297 aa  238  8e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  39.4 
 
 
312 aa  237  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  43.38 
 
 
325 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  43.66 
 
 
325 aa  228  8e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  40.68 
 
 
342 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  42.91 
 
 
323 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  41.11 
 
 
320 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  40.47 
 
 
323 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  39.12 
 
 
323 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  38.98 
 
 
345 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  39.86 
 
 
321 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  40.39 
 
 
308 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  39.3 
 
 
308 aa  196  6e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.75168e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  32.55 
 
 
358 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 
360 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 
350 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.63 
 
 
348 aa  174  1e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  34.66 
 
 
371 aa  175  1e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.55 
 
 
380 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  29.24 
 
 
361 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.34 
 
 
381 aa  165  1e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  30.95 
 
 
366 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.63 
 
 
313 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.74 
 
 
343 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  31.96 
 
 
308 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.19 
 
 
330 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.72 
 
 
363 aa  153  3e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 
353 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 
326 aa  140  2e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.22 
 
 
306 aa  140  2e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  30.41 
 
 
339 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  33.46 
 
 
336 aa  135  1e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 
386 aa  134  2e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  27.39 
 
 
346 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  27.85 
 
 
331 aa  132  7e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.05 
 
 
345 aa  129  7e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 
350 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.39 
 
 
338 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.34 
 
 
335 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.6 
 
 
332 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  27.94 
 
 
336 aa  121  2e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 
339 aa  118  2e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  26.14 
 
 
343 aa  117  2e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 
309 aa  116  4e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 
328 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.24 
 
 
337 aa  116  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.33 
 
 
339 aa  115  7e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  29.81 
 
 
350 aa  115  7e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  31.22 
 
 
379 aa  115  1e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  28.09 
 
 
316 aa  113  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.01 
 
 
353 aa  113  4e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.01 
 
 
349 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  27.18 
 
 
317 aa  111  1e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.59 
 
 
349 aa  111  1e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 
315 aa  112  1e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  27 
 
 
336 aa  111  1e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  24.25 
 
 
351 aa  110  2e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  28.24 
 
 
349 aa  110  2e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  30.73 
 
 
389 aa  111  2e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.25 
 
 
351 aa  110  2e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.11 
 
 
322 aa  111  2e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  24.25 
 
 
351 aa  110  2e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  24.25 
 
 
351 aa  110  2e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.25 
 
 
351 aa  110  2e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.25 
 
 
351 aa  110  2e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  23.55 
 
 
331 aa  111  2e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  27.6 
 
 
350 aa  109  7e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.92 
 
 
351 aa  109  7e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.92 
 
 
351 aa  108  8e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  24.25 
 
 
351 aa  108  9e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  28.35 
 
 
336 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  25.57 
 
 
369 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  24.58 
 
 
351 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  28.57 
 
 
310 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  26.09 
 
 
346 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  27.04 
 
 
362 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  26.09 
 
 
346 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  29.69 
 
 
362 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.36 
 
 
320 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.6 
 
 
348 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  27.02 
 
 
302 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 
349 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  24.37 
 
 
321 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  25.88 
 
 
349 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.24 
 
 
340 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.59 
 
 
350 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  29.65 
 
 
347 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.59 
 
 
350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  25.63 
 
 
308 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.59 
 
 
350 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.26 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  29.91 
 
 
417 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  22.92 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.17 
 
 
348 aa  99  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  28.78 
 
 
340 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.9 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  24.83 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>