More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2369 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2369  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
271 aa  563  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2540  ABC transporter related  68.89 
 
 
271 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000131925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2491  ABC transporter related  68.89 
 
 
271 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
347 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
347 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  41.02 
 
 
548 aa  215  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
539 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0248  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0221  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0234  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0244  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  39.18 
 
 
619 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0269  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5077  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0251  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0023  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00286476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2758  ABC transporter related  40.53 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0211  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 
347 aa  211  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  40.62 
 
 
564 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
336 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3491  ABC transporter related  39.92 
 
 
283 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2995  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 
330 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
539 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
536 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
536 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  41.42 
 
 
538 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3924  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.02 
 
 
329 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0222  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 
326 aa  208  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0435  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 
330 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003660  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  41.84 
 
 
327 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  43.28 
 
 
592 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 
544 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  43.7 
 
 
592 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0151  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
348 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  41.09 
 
 
619 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4863  ABC transporter ATP-binding protein, putative oligo/dipeptide transport protein  40.3 
 
 
335 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.53 
 
 
590 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 
346 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  42.5 
 
 
539 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0614  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 
345 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  43.88 
 
 
592 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  40.15 
 
 
552 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  40.5 
 
 
550 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05950  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  37.4 
 
 
265 aa  205  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.149541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  42.35 
 
 
549 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.55 
 
 
322 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  41.03 
 
 
534 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2289  oligopeptide transporter ATP-binding component  42.86 
 
 
331 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.038391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 
327 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2365  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 
338 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.115358  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.5 
 
 
611 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3919  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 
337 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  40.25 
 
 
522 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
336 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  41.63 
 
 
531 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6295  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
325 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1988  oligopeptide transporter ATP-binding component  42.44 
 
 
331 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  40.5 
 
 
553 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  41.03 
 
 
546 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 
340 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 
341 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000893655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2779  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
336 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0549786  normal  0.0731119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2238  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.39 
 
 
327 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  39.57 
 
 
571 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  41.46 
 
 
611 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3651  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 
349 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  41.41 
 
 
543 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  41.45 
 
 
350 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1732  oligopeptide transporter ATP-binding component  41.34 
 
 
337 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.37 
 
 
333 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2067  oligopeptide transporter ATP-binding component  41.11 
 
 
333 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.702331  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  40.17 
 
 
539 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1957  oligopeptide transporter ATP-binding component  41.11 
 
 
333 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.473899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
563 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2160  oligopeptide transporter ATP-binding component  41.11 
 
 
333 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00241569  normal  0.0324737 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1006  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 
360 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0987  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 
360 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.84 
 
 
325 aa  201  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  40.17 
 
 
539 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2402  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.34 
 
 
337 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00590084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  40.08 
 
 
554 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  38.37 
 
 
542 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0875  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  41.7 
 
 
339 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01220  oligopeptide transporter ATP-binding component  41.34 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0846377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5112  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1415  oligopeptide transporter ATP-binding component  41.34 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.62339  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1355  oligopeptide transporter ATP-binding component  41.34 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00010775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>