190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2345 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  100 
 
 		 320 aa  648    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  70.31 
 
 		 322 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  70.31 
 
 		 322 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.58 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.69 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.88 
 
 		 332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.44 
 
 		 332 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.46 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.56 
 
 		 329 aa  291  8e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.46 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.94 
 
 		 332 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  45.18 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  43.53 
 
 		 582 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.44 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.82 
 
 		 331 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.71 
 
 		 333 aa  265  7e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.08 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  41.28 
 
 		 583 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  39.16 
 
 		 567 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.24 
 
 		 327 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  40 
 
 		 572 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.02 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.42 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  39.39 
 
 		 569 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  39.39 
 
 		 569 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  39.7 
 
 		 566 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  39.39 
 
 		 566 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.86 
 
 		 333 aa  248  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  39.39 
 
 		 616 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.41 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  39.16 
 
 		 616 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  37.58 
 
 		 694 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.18 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  39.46 
 
 		 570 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  39.46 
 
 		 570 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  40.06 
 
 		 583 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.95 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.83 
 
 		 354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  40.06 
 
 		 583 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  39.16 
 
 		 570 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.88 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.37 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.37 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 583 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.45 
 
 		 329 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.56 
 
 		 330 aa  241  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  43.21 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.74 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  45.31 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  37.88 
 
 		 695 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.08 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.75 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.46 
 
 		 369 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  40.17 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.17 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  40.17 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.51 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.17 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.75 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.17 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.17 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  41.03 
 
 		 567 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.2 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.64 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.64 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.17 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  38.95 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.34 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.83 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.2 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.1 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.88 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.33 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  43.99 
 
 		 327 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.62 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  40.79 
 
 		 567 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  38.79 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  37.88 
 
 		 694 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  38.48 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  35.67 
 
 		 333 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  38.18 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  38.3 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  35.44 
 
 		 580 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  37.42 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.32 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  38.18 
 
 		 700 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  38.56 
 
 		 548 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  36.77 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  37.58 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.42 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.42 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  38.7 
 
 		 542 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  37.92 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>