More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2137 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  54.74 
 
 
607 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1227    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  64.32 
 
 
603 aa  803    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  64.32 
 
 
603 aa  803    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  52.81 
 
 
604 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  52.81 
 
 
604 aa  627  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  37.33 
 
 
604 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  39.27 
 
 
641 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  32.31 
 
 
625 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  33.17 
 
 
632 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  33.39 
 
 
621 aa  334  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  34.04 
 
 
605 aa  329  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  32.64 
 
 
656 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  32.32 
 
 
621 aa  321  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  32.77 
 
 
584 aa  271  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  32.28 
 
 
673 aa  259  8e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  29.42 
 
 
635 aa  251  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  29.49 
 
 
645 aa  246  8e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  31.88 
 
 
671 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  32.18 
 
 
977 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  27.27 
 
 
716 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  37.6 
 
 
710 aa  216  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  33.8 
 
 
646 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0716  putative acyltransferase  27.15 
 
 
606 aa  208  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  37.46 
 
 
546 aa  208  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  36.24 
 
 
671 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5206  acyltransferase 3  33.42 
 
 
793 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236489  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15740  predicted acyltransferase  33.25 
 
 
719 aa  199  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221169  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  31.59 
 
 
680 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  32 
 
 
681 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  32 
 
 
681 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  34.95 
 
 
671 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  28.6 
 
 
592 aa  195  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3022  acyltransferase 3  26.87 
 
 
646 aa  190  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399387  hitchhiker  0.00791396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  25.26 
 
 
685 aa  187  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  31.01 
 
 
711 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  31 
 
 
734 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  28.68 
 
 
679 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0298  acyltransferase 3  28.15 
 
 
603 aa  177  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.613325  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.33 
 
 
662 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  33.9 
 
 
685 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  31.17 
 
 
435 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.56 
 
 
679 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  32.8 
 
 
710 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  32.8 
 
 
710 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.69 
 
 
656 aa  170  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  33.16 
 
 
660 aa  170  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.49 
 
 
695 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  31.86 
 
 
718 aa  168  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  32.5 
 
 
673 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.7 
 
 
690 aa  166  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  35.05 
 
 
622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  30.4 
 
 
684 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0580  acyltransferase 3  24.27 
 
 
602 aa  164  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  33.9 
 
 
777 aa  164  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  27.83 
 
 
720 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.7 
 
 
681 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  32.77 
 
 
671 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  33.93 
 
 
688 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  31.2 
 
 
635 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1910  acyltransferase  26.84 
 
 
607 aa  160  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.8 
 
 
716 aa  160  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  28.57 
 
 
726 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  28.57 
 
 
726 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  28.57 
 
 
726 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.18 
 
 
682 aa  158  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  30.77 
 
 
629 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  30.77 
 
 
647 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.54 
 
 
656 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  34.25 
 
 
696 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.23 
 
 
632 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.59 
 
 
675 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  29.59 
 
 
675 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  29.13 
 
 
683 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  32.14 
 
 
690 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  33.62 
 
 
360 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.97 
 
 
643 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  33.89 
 
 
603 aa  153  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.16 
 
 
690 aa  153  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.39 
 
 
667 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  26.02 
 
 
592 aa  151  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  30.1 
 
 
715 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  32.19 
 
 
690 aa  151  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  32.28 
 
 
634 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  25.85 
 
 
675 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  32.39 
 
 
665 aa  150  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  30.37 
 
 
665 aa  150  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  28.87 
 
 
630 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  30.7 
 
 
629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  32.71 
 
 
640 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  30.97 
 
 
629 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  30.49 
 
 
660 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  32.34 
 
 
381 aa  147  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  30.33 
 
 
645 aa  147  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  29.33 
 
 
660 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.66 
 
 
675 aa  145  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  30.9 
 
 
695 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.49 
 
 
660 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  29.83 
 
 
695 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  28.17 
 
 
713 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>