130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2117 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  100 
 
 		 130 aa  256  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2564  LrgA family protein  78.7 
 
 		 131 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2617  LrgA family protein  78.7 
 
 		 131 aa  157  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  36.36 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  36.36 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  36.36 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  36.13 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  36.13 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  32.41 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  32.41 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  32.41 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  37.14 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  30.56 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  31.9 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  27.78 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  30.65 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  28.95 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  32.5 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  35.83 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  27.87 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  29.91 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  32.46 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  29.06 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  29.06 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  29.06 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  29.06 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  29.6 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  29.06 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  29.06 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  32.26 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  29.06 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  28.33 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  29.51 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  31.68 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  29.66 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  29.66 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  29.66 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  30.19 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  27.59 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3677  holin-like protein  28.95 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  23.93 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  31.63 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0775  LrgA  31.63 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  37.33 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  38.24 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  28.45 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  28.35 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  34.67 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  34.67 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  34.67 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  34.67 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  34.67 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  35.29 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  27.35 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  36.92 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02118  hypothetical protein  25 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  25.93 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  30.61 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003697  antiholin-like protein LrgA  25 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  25.64 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  25.49 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0706  LrgA family protein  34.67 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  24.79 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  22.69 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  24.58 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  31.63 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  31.63 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  31.63 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  24.55 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  22.69 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  31.63 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  32.98 
 
 		 171 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  26.13 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  30 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  28.85 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  23.89 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  21.85 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  22.32 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1483  putative effector of murein hydrolase LrgA  36.46 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000434709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  25.45 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  25.45 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  25.45 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  26.32 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  25.45 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>