More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2007 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  81.14 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  81.14 
 
 		 228 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  55.7 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  55.11 
 
 		 229 aa  261  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  53.51 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 		 249 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  54.82 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  57.96 
 
 		 229 aa  250  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  50.64 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  53.98 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  51.1 
 
 		 247 aa  244  9e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  52.34 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  51.32 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  50.66 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50.88 
 
 		 247 aa  237  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  50.44 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  51.75 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  50.44 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  49.12 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  51.32 
 
 		 234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50 
 
 		 248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  49.12 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  48.67 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 251 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  51.77 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 247 aa  231  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  51.32 
 
 		 230 aa  231  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  49.56 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  49.12 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  50 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  52.19 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.68 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  48.68 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 245 aa  228  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  48.68 
 
 		 228 aa  227  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  48.68 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  48.7 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  46.96 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  48.68 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 248 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  47.81 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  48.88 
 
 		 247 aa  224  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  51.09 
 
 		 247 aa  224  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  48.68 
 
 		 270 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  48.89 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 		 245 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  49.12 
 
 		 249 aa  223  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  46.46 
 
 		 250 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  48.68 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  46.93 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  47.6 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  45.58 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>