More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2005 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  81.54 
 
 		 259 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  81.54 
 
 		 259 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  46.99 
 
 		 265 aa  238  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.06 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  48.31 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  48.31 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  48.31 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.88 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.88 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  47.39 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.74 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  45.11 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  46.19 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  43.08 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  44.23 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  45.76 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  44.44 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  45.3 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  46.19 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  45.06 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.92 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  41.96 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  44.07 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  45.61 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.61 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 		 503 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  43.72 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  45.81 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  44.31 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  38.67 
 
 		 257 aa  204  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.24 
 
 		 503 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 		 489 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  40.69 
 
 		 489 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  42.86 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.26 
 
 		 489 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  38.82 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  41.96 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  40.08 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.38 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.94 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.96 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.14 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.34 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.06 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.87 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  38.2 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 284 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.34 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  34.98 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  34.62 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  33.96 
 
 		 502 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  33.96 
 
 		 502 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  36.17 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  35.5 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  36.17 
 
 		 315 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  36.17 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  32.95 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  36.48 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  34.72 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  34.72 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  34.72 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>