113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1952 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 350 aa  697    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  53.28 
 
 		 351 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  53.28 
 
 		 351 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  29.17 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  30.39 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  30.11 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  30.11 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  30.11 
 
 		 354 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  30.11 
 
 		 354 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  29.83 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  29.83 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  27.2 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  27.2 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  26.7 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1858  hypothetical protein  26.24 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  27.4 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  25.14 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4604  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0687  peptide ABC transporter permease  32.7 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  25.83 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1934  hypothetical protein  24.22 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0348  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0572  peptide ABC transporter permease  30.53 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.26303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1347  peptide ABC transporter permease  30.25 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3627  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00453674  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1048  peptide ABC transporter permease  28.53 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4149  hypothetical protein  24.39 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2883  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.07735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  21.74 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2484  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0213564  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00290  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.63 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3382  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3483  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  20.75 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  22.42 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  21.14 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  19.73 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  21.95 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  19.76 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  19.76 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  19.76 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  28.1 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 853 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  20 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  20 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.17 
 
 		 400 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  21.93 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  19.08 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.7 
 
 		 858 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  25.73 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  18.4 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2197  ABC transporter, permease protein  19.77 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000154518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  19.66 
 
 		 397 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  21.4 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  21.89 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04050  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.94 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.057296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  25.18 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  22.37 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  18.07 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.73 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  25.47 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.6 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  23.27 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  21.5 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  25.6 
 
 		 407 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  20.64 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  20.85 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  19.76 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  28.28 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  28.28 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  25.57 
 
 		 684 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  28.28 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  28.28 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  28.28 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  16.93 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  30.08 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  20.95 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  20.91 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  21.32 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  20.88 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  28.1 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  24.82 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.42 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  20.96 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  21.86 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 848 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  26.21 
 
 		 419 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  21.86 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>