139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1873 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 229 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  76.42 
 
 		 229 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  76.42 
 
 		 229 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  45.61 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  38.39 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  37.22 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  40.44 
 
 		 232 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  38.67 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  39.74 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  36.84 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  35.27 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  31.44 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  27.03 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  26.24 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  26.24 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  24.32 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  27.51 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  27.35 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24.11 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.89 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  24.66 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  23.61 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  24.77 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  26.34 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  25.68 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  25.68 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  25.23 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  24.45 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  25.23 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  24.22 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  23.53 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  23.77 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  21.4 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  26.85 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  22.87 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  24.44 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  25.56 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  25.56 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  22.32 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  21.59 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  23.91 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  26.34 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  22.37 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  22.94 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  21.7 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  22.71 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  23.56 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  24.22 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  21.33 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  23.66 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  25.23 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  24.78 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  23.97 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  22.51 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  22.91 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  22.83 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  21.7 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  22.98 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  21.65 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  21.7 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  21.88 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  22.94 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  22.42 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  22.83 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  23.28 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  21.7 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  21.78 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  21.33 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  22.52 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  22.41 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  21.88 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  22.07 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  20.94 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  22.51 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  22.27 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  21.46 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  21.6 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  22.78 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  20.66 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  23.77 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  22.71 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  20.85 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  20.85 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  21 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  20.87 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  21.15 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  24.14 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  22.81 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  22.17 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>