More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1829 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 91 aa  182  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  92.31 
 
 		 91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  92.31 
 
 		 91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  65.22 
 
 		 96 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  63.74 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  64.52 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  61.54 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  60.44 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  61.29 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  61.96 
 
 		 97 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 		 95 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  56.99 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  55.91 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  54.55 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  51.61 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  54.44 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  57.95 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  54.44 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  52.22 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  51.76 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  53.26 
 
 		 93 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  52.22 
 
 		 100 aa  90.1  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 		 95 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  52.94 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  53.93 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 94 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  50.56 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000650952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  51.65 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  52.5 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  51.61 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  53.26 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  52.22 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  51.25 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  51.11 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  51.76 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  54.95 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  48.89 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  48.15 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  45.68 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  51.72 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  51.65 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  51.11 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  51.04 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  47.25 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 94 aa  76.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  41.18 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  40.48 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  39.08 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>