More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1825 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  96.77 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  96.77 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  77.63 
 
 		 219 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  77.98 
 
 		 218 aa  358  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  77.98 
 
 		 218 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  75.8 
 
 		 219 aa  353  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  75.34 
 
 		 219 aa  351  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  72.81 
 
 		 217 aa  335  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  72.81 
 
 		 217 aa  331  6e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  70.97 
 
 		 217 aa  321  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  70.59 
 
 		 221 aa  321  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  68.37 
 
 		 226 aa  313  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  68.57 
 
 		 222 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  62.1 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  62.39 
 
 		 218 aa  290  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  63.93 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  60.55 
 
 		 221 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  62.39 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  63.43 
 
 		 219 aa  284  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  62.5 
 
 		 229 aa  282  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  62.84 
 
 		 220 aa  281  6.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  62.33 
 
 		 223 aa  280  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 222 aa  278  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  63.21 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  63.21 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  62.2 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  61.54 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 224 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 224 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  59.13 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  59.05 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 211 aa  268  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 211 aa  267  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  58.1 
 
 		 211 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  56.34 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  56.81 
 
 		 302 aa  262  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  57 
 
 		 223 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  57.75 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  58.69 
 
 		 267 aa  259  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  57.67 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 227 aa  258  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  57.69 
 
 		 234 aa  258  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 243 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 243 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  56.8 
 
 		 275 aa  255  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 252 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  254  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 237 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 240 aa  251  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 210 aa  251  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 248 aa  250  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  53.37 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  54.88 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  54.88 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  52.88 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  54.25 
 
 		 395 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  54.29 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  51.87 
 
 		 237 aa  246  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 224 aa  246  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  51.87 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  54.26 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0191  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.339095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>