More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1815 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
120 aa  241  2e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  88.33 
 
 
119 aa  209  8e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  88.33 
 
 
119 aa  209  8e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  178  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  178  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  178  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  178  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  178  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  177  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 
120 aa  176  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  176  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 
120 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 
118 aa  169  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 
119 aa  168  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 
118 aa  167  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  65 
 
 
120 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 
118 aa  163  6e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  63.33 
 
 
117 aa  155  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  63.33 
 
 
118 aa  154  5e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  60 
 
 
119 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  144  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  55.08 
 
 
124 aa  140  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
121 aa  140  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  56.56 
 
 
122 aa  139  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  56.56 
 
 
122 aa  139  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
124 aa  137  4e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
119 aa  137  5e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
119 aa  137  5e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  56.67 
 
 
116 aa  137  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  55.74 
 
 
122 aa  137  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 
115 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
122 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.52303e-10 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  63.39 
 
 
120 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  60.71 
 
 
125 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
121 aa  134  3e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 
121 aa  135  3e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  59.35 
 
 
119 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 
136 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.97313e-06  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  54.7 
 
 
116 aa  133  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  55.46 
 
 
118 aa  131  2e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  132  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  132  2e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  52.42 
 
 
124 aa  132  2e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
122 aa  131  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 
114 aa  131  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
120 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  55.28 
 
 
119 aa  131  4e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  131  4e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 
115 aa  130  6e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
137 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  130  7e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 
122 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  129  1e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 
122 aa  129  1e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  129  1e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 
116 aa  129  1e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 
120 aa  129  1e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  59.82 
 
 
117 aa  129  1e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.57389e-05  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 
122 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  56.14 
 
 
116 aa  129  2e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  54.92 
 
 
122 aa  129  2e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 
122 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  60.71 
 
 
120 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  60.71 
 
 
120 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  60.71 
 
 
120 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 
122 aa  127  5e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
122 aa  127  5e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
114 aa  127  5e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  61.62 
 
 
117 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  53.33 
 
 
117 aa  126  9e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  58.93 
 
 
120 aa  126  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
122 aa  126  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
121 aa  125  1e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  61.48 
 
 
122 aa  126  1e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.1695e-07  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  52.07 
 
 
121 aa  126  1e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  53.72 
 
 
121 aa  125  2e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  53.45 
 
 
116 aa  125  2e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
120 aa  124  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
120 aa  124  4e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
120 aa  124  4e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 
120 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 
122 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  54.92 
 
 
122 aa  123  8e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  9.83895e-07 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  51.69 
 
 
118 aa  123  8e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  51.79 
 
 
128 aa  123  8e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
120 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  58.25 
 
 
117 aa  123  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  51.69 
 
 
121 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
122 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
122 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
118 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  51.24 
 
 
119 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  55.45 
 
 
126 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  54.13 
 
 
118 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  56.99 
 
 
118 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  48.76 
 
 
121 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.58089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  51.82 
 
 
118 aa  121  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.579e-15  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>