More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1811 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 430 aa  854    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  89.07 
 
 		 430 aa  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  89.07 
 
 		 430 aa  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  59.95 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  60.19 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  60.19 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  60.19 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  60.19 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  60.19 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  60.19 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  60.19 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  59.95 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  58.37 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  57.74 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  57.74 
 
 		 434 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  57.97 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  57.74 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  57.97 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  57.64 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  57.51 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  57.51 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  59.95 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  57.74 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  58.1 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  58.33 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  57.44 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.85 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  47.27 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.47 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  45.85 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  46.17 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0142  preprotein translocase, SecY subunit  56.65 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.58947e-61 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  46.23 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.99 
 
 		 420 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.78 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.63 
 
 		 421 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.79 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  42.52 
 
 		 418 aa  345  8e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  45.41 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  43.22 
 
 		 419 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  43.62 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.06 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.18 
 
 		 447 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.7 
 
 		 419 aa  332  7.000000000000001e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.59 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  42.63 
 
 		 427 aa  332  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 421 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.6 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.46 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  40.88 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  39.86 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  42.4 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  41.01 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  39.03 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  41.75 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  41.22 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  40.69 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  40.69 
 
 		 443 aa  319  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  38.11 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  41.37 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0271  preprotein translocase, SecY subunit  43.15 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.523157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  39.03 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  39.45 
 
 		 435 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  40.43 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 		 454 aa  316  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  38.91 
 
 		 446 aa  315  9e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  38.77 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  40.46 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  40.28 
 
 		 440 aa  312  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  41.24 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  39.22 
 
 		 435 aa  312  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.28 
 
 		 448 aa  312  9e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  39.13 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.18 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  41.11 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  39.72 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  40.33 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  40.46 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  41.61 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  37.95 
 
 		 432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  40.6 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  38.5 
 
 		 437 aa  308  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  40.46 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  39.96 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  39.53 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  38.01 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  39.69 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  38.99 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  39.25 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  38.57 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  41.71 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>