More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1789 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  100 
 
 		 470 aa  971    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  93.62 
 
 		 470 aa  920    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  80.43 
 
 		 468 aa  800    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  93.62 
 
 		 470 aa  920    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  55.13 
 
 		 475 aa  533  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  54.04 
 
 		 468 aa  529  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  50.75 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  40.34 
 
 		 465 aa  320  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  39.03 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  38.64 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  37.84 
 
 		 451 aa  295  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  37 
 
 		 446 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  38.75 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  33.69 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  36.46 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  35.04 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  37.24 
 
 		 469 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  36.5 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38.36 
 
 		 478 aa  280  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  37.21 
 
 		 478 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  35.49 
 
 		 446 aa  277  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  35.28 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  36.42 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  34.24 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  35.61 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  35.59 
 
 		 458 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  35.13 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  36.08 
 
 		 448 aa  267  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  35.11 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  37.47 
 
 		 478 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  34.31 
 
 		 461 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  34.9 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  34.38 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  36.33 
 
 		 457 aa  260  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  34.12 
 
 		 463 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  35.39 
 
 		 450 aa  259  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  35.28 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  36.65 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.47 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  33.9 
 
 		 467 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  34.38 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  35.02 
 
 		 462 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  35.02 
 
 		 461 aa  255  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  33.12 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  34.17 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  33.05 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  35.71 
 
 		 482 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  34.68 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  32 
 
 		 462 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  33.61 
 
 		 484 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  30.72 
 
 		 499 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  33.4 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  34.92 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  33.4 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  33.4 
 
 		 488 aa  247  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  33.19 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  32.49 
 
 		 494 aa  246  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  33.19 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  35.85 
 
 		 474 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  34.39 
 
 		 476 aa  246  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  31.79 
 
 		 470 aa  246  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  32.44 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  31.35 
 
 		 500 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  33.62 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  34.11 
 
 		 909 aa  243  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  31.58 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  32.35 
 
 		 460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  33.97 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  32.14 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  32.35 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  32.14 
 
 		 460 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.83 
 
 		 439 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  33.4 
 
 		 455 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 456 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  33.62 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  32.35 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  31.9 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  32.64 
 
 		 465 aa  237  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  33.05 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  34.51 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  30.79 
 
 		 479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  32.32 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  34.64 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  35.16 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  33.62 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  32.77 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0942  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  33.13 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.933475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0575  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  34.01 
 
 		 476 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  32.84 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  34.38 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  32.49 
 
 		 466 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  33.48 
 
 		 457 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  32.38 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  31.66 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  32.78 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  32.61 
 
 		 463 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  34.6 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  30.53 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  33.82 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  33.19 
 
 		 475 aa  229  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>