214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1714 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
70 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
70 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
70 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  83.33 
 
 
72 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  66.67 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  62.5 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  82.61 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  72.73 
 
 
72 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  68.75 
 
 
77 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  54.1 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  53.85 
 
 
70 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  50.82 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  57.45 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  54.1 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  52.46 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  58.82 
 
 
95 aa  60.5  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4796  ATP synthase F0, C subunit  67.57 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000270119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  52.83 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  51.47 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  48.48 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  52.31 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  52.31 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50.85 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  50.77 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  57.78 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  52.86 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  52.86 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  42.42 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3971  F0F1 ATP synthase subunit C  50.75 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000527403  normal  0.270101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  48.28 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3289  ATP synthase F0, C subunit  51.43 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.524691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  48.28 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4612  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.37 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  57.5 
 
 
72 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  51.72 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  49.25 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5418  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.000148826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73300  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.731054  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5436  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  45.9 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5300  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371709  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5205  F0F1 ATP synthase subunit C  51.43 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158761  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  53.33 
 
 
78 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
73 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52210  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
78 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  51.52 
 
 
82 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
73 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  47.76 
 
 
85 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4370  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00324113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4903  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000000864371  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4752  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4512  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00265019  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4022  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0586605  normal  0.864238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4050  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4135  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000070467  hitchhiker  0.00469633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4315  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0295154  hitchhiker  0.0000000000618272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4371  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  50.72 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4467  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000500836  hitchhiker  0.00000000117641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 
92 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 
74 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>