127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1685 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  39.62 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  39.62 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  30.19 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  29.68 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  30.19 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  26.39 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  34.26 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  30.97 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  36.14 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  24.56 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  22.3 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  29.73 
 
 		 486 aa  58.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  29.7 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  28.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  28.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  28.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  23.33 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  28.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  27.63 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  28.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  28.71 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  31.46 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  28.71 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  22.52 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  22.79 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  28.71 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  34.12 
 
 		 632 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  30.3 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  32.94 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  35.09 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.17 
 
 		 575 aa  54.7  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  35.06 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  20.81 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  31.2 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  24.32 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  24.32 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  24.32 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  25.78 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  33 
 
 		 541 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  27.27 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  31.33 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  31.07 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  27.73 
 
 		 480 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  23.81 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  25.77 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  31 
 
 		 493 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 228 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  24.32 
 
 		 512 aa  51.2  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  23.33 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  28.16 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  31.82 
 
 		 522 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  26.17 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  32.94 
 
 		 579 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  22.56 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.91 
 
 		 530 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  29.27 
 
 		 491 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  31.96 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  24.83 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  27.38 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  25.2 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 547 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  22.31 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  28.7 
 
 		 619 aa  48.5  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  27.71 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  22.45 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  21.74 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  24.24 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  29.89 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 504 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  36.11 
 
 		 646 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  28.57 
 
 		 492 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  26.63 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  27.55 
 
 		 504 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  32.47 
 
 		 555 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  29.73 
 
 		 507 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  25.15 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  24.42 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  22.7 
 
 		 673 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  30.59 
 
 		 549 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  38.96 
 
 		 494 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 476 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  23.4 
 
 		 700 aa  45.1  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  26.19 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  31.48 
 
 		 514 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>