155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1679 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  100 
 
 		 108 aa  216  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  88.89 
 
 		 108 aa  194  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  88.89 
 
 		 108 aa  194  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  44.34 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  43.4 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  43.4 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  43.4 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  43.4 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  44.34 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  43.4 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  42.45 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  42.45 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  42.45 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  39.62 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  40.57 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.79 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  37.74 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  41.05 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  33.96 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  42.05 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  25.25 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  25.58 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  41.05 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.62 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.59 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.01 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  25.77 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  25.74 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  22.33 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  37.7 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.91 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  25.3 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  26.53 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.74 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  25.29 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.25 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  23.58 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0914  STAS domain protein  30.95 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  33.72 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  24.42 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  29.89 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.37 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  27.27 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>