More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1673 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  100 
 
 		 422 aa  873    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  85.55 
 
 		 422 aa  738    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  85.55 
 
 		 422 aa  738    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  55.16 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  55.08 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  55 
 
 		 420 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  54.76 
 
 		 420 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  54.85 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  54.61 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  54.85 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  55.21 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  54.61 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  54.29 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  55.61 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  54.05 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  54.76 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  55.29 
 
 		 423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  54.09 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  55.47 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  50.71 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  52.63 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  50.62 
 
 		 437 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  52.28 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  48.82 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  52.46 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  45.1 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  45.1 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  45.1 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  46.58 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 420 aa  359  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  45.25 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 413 aa  345  8e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  43.26 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  42.52 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  43.23 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  40.67 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  40.84 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  42.09 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  42.96 
 
 		 431 aa  322  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  41.59 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  43.22 
 
 		 412 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  41.27 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  43.42 
 
 		 408 aa  309  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  44.08 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  41.53 
 
 		 415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 511 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  40.52 
 
 		 526 aa  289  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 511 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  40 
 
 		 514 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  39.74 
 
 		 511 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 509 aa  286  7e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  42.34 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  41.18 
 
 		 509 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  39.68 
 
 		 507 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  40.53 
 
 		 549 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.02 
 
 		 507 aa  275  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  41.91 
 
 		 504 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  39.02 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.42 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.42 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  42.35 
 
 		 529 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  37.8 
 
 		 501 aa  272  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  38.62 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  38.93 
 
 		 527 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  39.53 
 
 		 505 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  37.89 
 
 		 517 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  36.96 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0303  threonine dehydratase  40.44 
 
 		 565 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0613066  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  38.61 
 
 		 501 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 517 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  38.59 
 
 		 606 aa  262  6.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  39.79 
 
 		 509 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 517 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 510 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  36.65 
 
 		 507 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  36.65 
 
 		 507 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  36.39 
 
 		 507 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0679  threonine dehydratase  41.98 
 
 		 520 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0606689  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  35.41 
 
 		 505 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0658  threonine dehydratase  41.98 
 
 		 520 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0435798  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  36.65 
 
 		 507 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  38.08 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  38.36 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  38.57 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  35.66 
 
 		 503 aa  256  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  36.63 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  38.33 
 
 		 403 aa  253  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  37.31 
 
 		 531 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  38.52 
 
 		 502 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  36.59 
 
 		 520 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0743  threonine dehydratase  41.39 
 
 		 519 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>