72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1499 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  155  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  86.3 
 
 		 74 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  86.3 
 
 		 74 aa  140  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  60.27 
 
 		 76 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  65.28 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  58.9 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  58.9 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  58.11 
 
 		 75 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  56.94 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  54.17 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  55.07 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  39.44 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  39.44 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  32.86 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  31.43 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  31.43 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  30.99 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.23 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  27.78 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  31.43 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  32.2 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  29.58 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  28.79 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  26.67 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  31.82 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  33.9 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  28.57 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  32.39 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  25 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  30.51 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  30.99 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  26.79 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  30.99 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  31.15 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  32.26 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  38.78 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  32.69 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  28.79 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0043  hypothetical protein  31.51 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  26.67 
 
 		 76 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  25.35 
 
 		 80 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  28.77 
 
 		 78 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>