More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1494 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  100 
 
 
319 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  61.71 
 
 
319 aa  417  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  61.71 
 
 
319 aa  417  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  39.56 
 
 
323 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  37.97 
 
 
322 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.38 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  37.18 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  36.22 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  36.84 
 
 
313 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  34.06 
 
 
322 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  36.05 
 
 
313 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  36.05 
 
 
313 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  36.05 
 
 
313 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  34.91 
 
 
308 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  35.76 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  34.24 
 
 
315 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  34.26 
 
 
315 aa  188  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  33.02 
 
 
337 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  36.53 
 
 
314 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  33.33 
 
 
323 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  33.86 
 
 
355 aa  186  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  34.39 
 
 
323 aa  182  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  35.4 
 
 
319 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.39 
 
 
306 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.61 
 
 
323 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  36.56 
 
 
310 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.96 
 
 
320 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.33 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.15 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  33.55 
 
 
321 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  33.87 
 
 
328 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 
319 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.29 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  28.71 
 
 
307 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  32.73 
 
 
331 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.48 
 
 
304 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.48 
 
 
304 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.01 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 
323 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  30.43 
 
 
337 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  31.79 
 
 
338 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  28.48 
 
 
311 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  31.68 
 
 
338 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  28.21 
 
 
309 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  29.81 
 
 
322 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  30.94 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 
316 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.99 
 
 
347 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
315 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.79 
 
 
323 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  34.39 
 
 
307 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.36 
 
 
319 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  32.9 
 
 
315 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  29.05 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  29.05 
 
 
319 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  31.33 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.3 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  28.34 
 
 
307 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.81 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  30.23 
 
 
341 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.81 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  30.52 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
319 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 
319 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  27.81 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  27.81 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  31.35 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  27.5 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  28.31 
 
 
319 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.75 
 
 
314 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.96 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  30.13 
 
 
306 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  28.03 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  28.03 
 
 
316 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  29.41 
 
 
325 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  28.04 
 
 
333 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  28.25 
 
 
316 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.26 
 
 
323 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  27.85 
 
 
310 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.35 
 
 
333 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  29.21 
 
 
323 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.31 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  30.52 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
318 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  27.41 
 
 
315 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.17 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 
307 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  30.23 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  29.41 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  29.45 
 
 
308 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.06 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  28.85 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  27.33 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  28.99 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  27.85 
 
 
325 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>