More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1466 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  100 
 
 		 370 aa  751    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  52.96 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  44.88 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  62.05 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  37.02 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  37.02 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  37.02 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  37.02 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  37.02 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  37.02 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  37.02 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  36.94 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  33.04 
 
 		 395 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  36.13 
 
 		 361 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  31.58 
 
 		 344 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  31.6 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  32.23 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  26.69 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  28.03 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  23.84 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  23.84 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  23.84 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  23.84 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  23.84 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  23.84 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  23.84 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.48 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  22.51 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.43 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  20.83 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  23.93 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  20.83 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  20.83 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  20.46 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  21.64 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  21.64 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  20.46 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  20.46 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.92 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  27.23 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  25.38 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.93 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  33 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.88 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.32 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  24.16 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  24.41 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.69 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  24.62 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  26.51 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  23.64 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.13 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.09 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.73 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.76 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  23.77 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.41 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  27.94 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  28.11 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.81 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  22.94 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  23.85 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  27.44 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.78 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  23.64 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.69 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  28.49 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  23.62 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  23.37 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  23.37 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.94 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  26.37 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  23.37 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  27.94 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  20.25 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  22.48 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  26.67 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>