More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1465 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  100 
 
 		 675 aa  1387    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  56.76 
 
 		 701 aa  804    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  56.66 
 
 		 684 aa  804    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  48.31 
 
 		 708 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  25.55 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  25.55 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  25.55 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  26.63 
 
 		 637 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  27.47 
 
 		 498 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  24.78 
 
 		 721 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 721 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 737 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 663 aa  111  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  22.85 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 637 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  23.46 
 
 		 637 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  22.66 
 
 		 426 aa  88.6  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  22.69 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  22.63 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  23.17 
 
 		 608 aa  69.7  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  23.17 
 
 		 608 aa  68.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  23.17 
 
 		 608 aa  68.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  22.46 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  22.46 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  22.46 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  24.86 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  24.43 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.35 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.16 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.47 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  30.29 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.84 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  32.69 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  23.1 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.64 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  22.65 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  23.13 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  22.65 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  22.65 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  22.65 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  22.65 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  26.32 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  26.61 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  22.22 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  22.22 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.31 
 
 		 300 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.76 
 
 		 299 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  29.02 
 
 		 297 aa  56.6  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  24.7 
 
 		 317 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  27.45 
 
 		 189 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  23.64 
 
 		 388 aa  56.2  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  21.85 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  25.75 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  29.81 
 
 		 309 aa  55.5  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  38.33 
 
 		 316 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  22.81 
 
 		 409 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  40 
 
 		 400 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 329 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  26.03 
 
 		 443 aa  55.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.97 
 
 		 293 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  24.71 
 
 		 310 aa  55.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 293 aa  54.7  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  22.29 
 
 		 329 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  22.32 
 
 		 341 aa  54.7  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  29.19 
 
 		 354 aa  54.7  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  39.66 
 
 		 309 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 		 311 aa  54.3  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.48 
 
 		 330 aa  53.9  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  22.87 
 
 		 719 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.24 
 
 		 429 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  24.5 
 
 		 305 aa  53.5  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  24.28 
 
 		 326 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  22.11 
 
 		 331 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  22.87 
 
 		 719 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>