38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1402 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  742    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  79.95 
 
 
364 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  79.95 
 
 
364 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  37.81 
 
 
362 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  37.81 
 
 
381 aa  242  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  37.81 
 
 
362 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  37.81 
 
 
362 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  37.81 
 
 
362 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  37.81 
 
 
362 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  37.81 
 
 
362 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  38.08 
 
 
381 aa  238  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0451  hypothetical protein  37.81 
 
 
394 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  37.81 
 
 
362 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  37.81 
 
 
362 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  36.29 
 
 
353 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  34.18 
 
 
359 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  27.88 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  28.38 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2854  protein of unknown function DUF939  30.13 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1438  membrane protein-like protein  27.45 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  32 
 
 
328 aa  63.2  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2751  hypothetical protein  27.7 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2478  hypothetical protein  27.03 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000608339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2537  integral membrane protein  25.45 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000042014 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2513  hypothetical protein  27.03 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2743  hypothetical protein  27.03 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2557  hypothetical protein  27.03 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000442188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2797  hypothetical protein  26.35 
 
 
355 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  29.08 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2776  hypothetical protein  26.35 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  27.27 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  28.29 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  28.29 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  29.53 
 
 
708 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0310  hypothetical protein  27.7 
 
 
165 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  22.15 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  25.66 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  20.98 
 
 
354 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>