More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1356 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  83.13 
 
 
85 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  83.13 
 
 
85 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  66.67 
 
 
75 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  64.1 
 
 
78 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  66.67 
 
 
78 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  66.67 
 
 
78 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  66.67 
 
 
78 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  61.54 
 
 
78 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  64.1 
 
 
77 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  68.12 
 
 
81 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  68.12 
 
 
81 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  69.57 
 
 
107 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  62.16 
 
 
99 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  60.81 
 
 
86 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4368  protein of unknown function DUF37  67.65 
 
 
68 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.330154  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  63.38 
 
 
81 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  64.71 
 
 
69 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  63.24 
 
 
70 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  62.32 
 
 
206 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  62.32 
 
 
214 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  58.02 
 
 
85 aa  99.8  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  65.22 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  62.86 
 
 
70 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  68.18 
 
 
85 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  58.75 
 
 
80 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
71 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0605  hypothetical protein  60.56 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00151765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  54.55 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  50.62 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  59.42 
 
 
74 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  60 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  51.32 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.42 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  58.33 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
74 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  55 
 
 
79 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  55 
 
 
79 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  50.65 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0094  protein of unknown function DUF37  60.29 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  56.52 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  54.67 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  54.67 
 
 
132 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  56.52 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  53.42 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  58.33 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  57.97 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  55.07 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  55.07 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  55.07 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  53.66 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.26 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  56.52 
 
 
111 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  55.07 
 
 
70 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  55.88 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  55.88 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  52.44 
 
 
93 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  53.25 
 
 
84 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  48.81 
 
 
88 aa  90.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  53.62 
 
 
88 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
69 aa  90.1  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  53.62 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23590  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.47 
 
 
74 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000940525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  47.56 
 
 
86 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  51.95 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  46.91 
 
 
89 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  53.25 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  53.62 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  51.28 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  57.97 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  53.62 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  54.41 
 
 
69 aa  87.8  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>