More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1318 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
860 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
860 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
819 aa  850    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
813 aa  768    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
824 aa  749    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
868 aa  698    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 
858 aa  978    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
804 aa  1659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
887 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3415  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
864 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  74.47 
 
 
802 aa  1289    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
863 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  65.95 
 
 
833 aa  1160    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0370  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
864 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
859 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
868 aa  700    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  74.22 
 
 
802 aa  1286    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  74.1 
 
 
802 aa  1284    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 
801 aa  924    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  74.22 
 
 
802 aa  1286    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2453  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
864 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
823 aa  704    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
823 aa  700    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
868 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
876 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
830 aa  719    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
862 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
874 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
857 aa  642    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
872 aa  749    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3451  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
913 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
819 aa  724    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
868 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
851 aa  753    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
856 aa  661    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 
805 aa  926    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
884 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
805 aa  927    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
875 aa  678    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
824 aa  768    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
829 aa  764    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
877 aa  687    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  74.22 
 
 
802 aa  1286    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
856 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
865 aa  735    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
866 aa  673    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 
804 aa  950    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
862 aa  648    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
829 aa  836    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1211  leucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
882 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
858 aa  731    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
848 aa  659    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 
825 aa  846    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
819 aa  717    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
864 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
817 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
863 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
872 aa  701    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
856 aa  695    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3450  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
864 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
829 aa  762    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
859 aa  742    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
861 aa  689    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
856 aa  740    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
819 aa  723    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
878 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
971 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
817 aa  749    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
870 aa  712    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
862 aa  702    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
816 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
816 aa  805    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
860 aa  713    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 
929 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
859 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
859 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
864 aa  696    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
872 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
824 aa  809    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1229  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
864 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
817 aa  745    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
873 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  65.39 
 
 
829 aa  1106    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 
829 aa  1122    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  66.46 
 
 
804 aa  1113    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  66.29 
 
 
808 aa  1153    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 
833 aa  1149    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
843 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
971 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
829 aa  716    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
859 aa  705    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
859 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
832 aa  703    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
823 aa  745    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  56 
 
 
816 aa  919    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
848 aa  690    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
864 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
971 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
859 aa  695    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
968 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>