More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1203 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  95.25 
 
 
379 aa  766  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  95.25 
 
 
379 aa  766  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
379 aa  798  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.67 
 
 
379 aa  614  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.51523e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.67 
 
 
379 aa  614  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.67 
 
 
379 aa  614  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.27158e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.41 
 
 
379 aa  613  1e-174  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.56565e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.41 
 
 
379 aa  613  1e-174  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.8864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.41 
 
 
379 aa  613  1e-174  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.48017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.41 
 
 
379 aa  613  1e-174  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.10592e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.41 
 
 
379 aa  613  1e-174  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.75969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.41 
 
 
379 aa  613  1e-174  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.28432e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.41 
 
 
379 aa  613  1e-174  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.70513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.88 
 
 
379 aa  610  1e-174  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  73.4 
 
 
380 aa  604  1e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.07 
 
 
380 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.46 
 
 
374 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.65 
 
 
373 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.58 
 
 
375 aa  541  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.76 
 
 
380 aa  543  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.22 
 
 
380 aa  541  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.21 
 
 
369 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.02 
 
 
382 aa  526  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.86 
 
 
370 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.04 
 
 
373 aa  517  1e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.67 
 
 
370 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  64.4 
 
 
372 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  66.57 
 
 
373 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.56 
 
 
379 aa  498  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.88 
 
 
372 aa  497  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.67 
 
 
357 aa  475  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.29 
 
 
370 aa  453  1e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.71 
 
 
372 aa  454  1e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.95 
 
 
384 aa  451  1e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.07 
 
 
371 aa  453  1e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.56 
 
 
372 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 
406 aa  448  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.84 
 
 
373 aa  446  1e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
372 aa  447  1e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1289  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  58.21 
 
 
347 aa  442  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.28 
 
 
369 aa  441  1e-122  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.94 
 
 
387 aa  435  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
395 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.42 
 
 
384 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.52 
 
 
387 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.37 
 
 
374 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.93 
 
 
381 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.81 
 
 
392 aa  425  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.14 
 
 
370 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.2 
 
 
383 aa  421  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 
387 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.85 
 
 
368 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.63 
 
 
376 aa  421  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
368 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.65402e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.22 
 
 
375 aa  418  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.1 
 
 
383 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.37 
 
 
379 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.24 
 
 
382 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.99 
 
 
388 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.94 
 
 
380 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.2 
 
 
383 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.9 
 
 
374 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.12 
 
 
367 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.9 
 
 
374 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 
369 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.14064e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
387 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.18 
 
 
367 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.62 
 
 
381 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.9 
 
 
374 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  54.7 
 
 
382 aa  416  1e-115  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.59 
 
 
381 aa  417  1e-115  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 
392 aa  417  1e-115  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.39 
 
 
394 aa  416  1e-115  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.33 
 
 
392 aa  417  1e-115  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.7 
 
 
378 aa  415  1e-115  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.17 
 
 
392 aa  417  1e-115  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.46 
 
 
375 aa  417  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 
384 aa  415  1e-115  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
377 aa  415  1e-115  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87089e-06 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.23 
 
 
383 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.34 
 
 
374 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.18 
 
 
371 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.46 
 
 
366 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.59 
 
 
370 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.89 
 
 
367 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.97 
 
 
391 aa  411  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.18 
 
 
371 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 
375 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>